Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  426  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131398278--131398321
10
4.1
10
80
13
52
72
0
9
18
1.10
131407063--131407104
19
2.2
19
91
0
66
23
19
21
35
1.96
131409189--131409287
42
2.3
42
79
5
119
33
21
17
28
1.95
131409179--131409326
43
3.4
44
76
10
137
31
23
18
27
1.97
131418480--131418512
10
3.0
11
91
8
50
0
9
0
90
0.44
131419446--131419723
74
3.8
74
89
2
377
28
21
18
31
1.97
131419749--131420115
71
4.9
71
70
15
279
30
22
16
29
1.96
131419592--131420044
160
2.8
159
92
2
714
30
22
17
29
1.96
131419750--131420205
233
2.0
233
97
0
858
30
21
17
29
1.96
131419909--131420115
73
2.9
71
86
5
283
28
24
16
30
1.97
131439360--131439440
29
2.9
28
83
3
99
28
16
25
29
1.96
131447023--131447106
26
3.4
25
86
6
100
28
21
21
28
1.99
131447154--131447200
20
2.3
20
100
0
94
34
19
10
36
1.86
131447237--131447282
24
1.9
24
86
0
65
30
15
23
30
1.95
131456271--131456380
40
2.8
41
86
5
145
29
22
28
20
1.98
131456223--131456410
40
4.8
38
75
10
130
29
21
26
22
1.99
131461560--131461661
40
2.5
40
90
3
152
29
24
28
17
1.97
131461560--131461699
40
3.5
40
84
3
131
27
23
28
20
1.99
131471422--131471552
40
3.3
40
85
0
172
24
27
21
26
1.99
131471439--131471589
40
3.8
40
85
4
180
23
25
22
28
1.99
131479431--131479599
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
131485197--131485236
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131485944--131486092
40
3.7
40
83
0
181
25
22
26
24
2.00
131485944--131486162
40
5.5
40
77
7
142
27
23
26
22
2.00
131493604--131493753
40
3.8
40
84
2
187
25
24
27
23
2.00
131493605--131493795
78
2.4
79
82
4
206
27
24
26
21
1.99
131493642--131493821
78
2.3
79
79
4
184
28
24
25
21
1.99
131498649--131498751
29
3.6
29
81
2
118
23
16
32
28
1.96
131506600--131506702
29
3.6
29
81
2
118
23
16
32
28
1.96
131516872--131516956
26
3.3
26
80
9
104
40
21
20
18
1.92
131516872--131516971
26
3.9
25
78
7
94
38
21
21
20
1.94
131525319--131525375
30
1.9
30
88
0
87
35
8
21
35
1.84
131533422--131533470
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
131534290--131534440
40
3.8
40
80
6
164
26
22
27
23
2.00
131541398--131541446
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
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Size
Copy
Number
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
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72
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26
22
22
29
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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