Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  197  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58937457--58937487
13
2.3
14
94
5
55
16
6
3
74
1.16
58938667--58938699
16
2.1
16
94
5
59
30
0
0
69
0.88
58938668--58938728
25
2.4
27
81
10
74
32
1
0
65
1.02
58938667--58938726
17
3.5
17
80
8
61
30
1
0
68
0.99
58944133--58944407
139
2.0
139
94
0
478
36
19
12
31
1.88
58945987--58946039
24
2.2
24
96
0
97
43
26
7
22
1.80
58955243--58955280
6
6.3
6
93
0
67
63
34
0
2
1.09
58959520--58959554
17
2.1
17
100
0
70
42
5
5
45
1.51
58961387--58961462
37
2.1
37
100
0
152
38
13
13
35
1.83
58961784--58961869
25
3.4
25
96
0
154
31
15
22
31
1.94
58961784--58961894
50
2.2
50
87
3
152
29
17
22
30
1.96
58961858--58961909
25
2.1
25
82
7
61
30
23
21
25
1.99
58962050--58962093
22
2.0
23
86
4
63
54
9
2
34
1.44
58963143--58963175
16
2.1
16
100
0
66
39
12
24
24
1.89
58964852--58964879
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
58969358--58969413
28
2.0
28
96
0
103
17
16
17
48
1.82
58972692--58972748
28
2.0
28
86
6
80
40
31
3
24
1.72
58974511--58974553
16
2.6
16
85
14
61
30
0
4
65
1.13
58974604--58974648
21
2.1
21
83
0
54
24
4
4
66
1.29
58974647--58974689
18
2.4
18
80
7
52
34
0
0
65
0.93
58974621--58974700
42
2.0
41
87
7
119
31
0
0
68
0.90
58974747--58974788
15
2.6
17
81
11
52
66
2
0
30
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58975942--58975979
20
1.9
19
85
15
51
42
28
10
18
1.83
58980527--58980587
21
3.5
17
78
20
63
31
3
0
65
1.09
58980527--58980599
36
2.0
36
87
10
105
30
5
0
64
1.16
58980642--58980689
3
16.0
3
82
0
60
29
6
2
62
1.31
58980650--58980689
15
2.7
15
96
0
71
30
7
0
62
1.23
58980848--58980874
14
1.9
14
100
0
54
0
11
0
88
0.50
58981037--58981083
21
2.3
20
85
10
60
34
6
4
55
1.45
58993204--58993335
70
1.9
69
90
1
210
30
16
22
30
1.96
58993110--58993654
159
3.4
160
95
2
965
29
16
20
33
1.95
58993522--58993771
72
3.5
70
78
10
186
32
16
21
30
1.95
58993597--58993734
73
1.9
73
86
5
199
30
18
20
30
1.97
58993733--58993929
72
2.7
74
90
6
303
25
11
15
47
1.79
58993989--58994013
13
1.9
13
100
0
50
16
16
4
64
1.44
58995955--58996015
21
3.5
17
78
20
63
31
3
0
65
1.09
58995955--58996027
36
2.0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Period
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Indices
Period
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Copy
Number
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49
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3
31
1.62

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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