Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  389  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119630291--119630496
40
5.2
40
92
3
321
25
23
26
24
2.00
119633145--119633277
43
3.1
43
71
16
141
25
28
17
28
1.97
119633161--119633290
42
3.1
42
69
16
115
26
30
18
25
1.98
119636447--119636630
40
4.6
39
81
6
158
24
20
28
26
1.99
119636447--119636624
78
2.2
80
83
6
220
24
21
28
25
1.99
119637323--119637361
18
2.2
18
100
0
78
43
12
15
28
1.83
119638536--119638565
15
2.1
15
93
6
53
36
26
6
30
1.82
119643323--119643471
27
5.5
27
86
0
199
31
22
6
40
1.78
119643291--119643499
54
3.9
54
78
2
186
33
21
6
38
1.80
119643291--119643498
81
2.6
81
76
2
229
33
21
6
38
1.79
119643450--119643673
54
4.1
54
74
7
166
41
19
7
31
1.79
119643464--119643694
81
2.8
83
73
8
204
41
17
8
32
1.80
119643459--119643679
27
8.1
27
76
10
128
40
18
8
33
1.80
119644607--119644676
25
2.8
25
88
0
95
27
25
21
25
1.99
119644883--119644965
31
2.7
30
92
3
132
30
16
25
27
1.97
119644971--119645064
33
2.9
33
69
18
90
24
20
25
29
1.99
119647946--119648046
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
119663610--119664021
74
5.6
72
83
5
522
29
17
21
31
1.96
119663615--119664021
150
2.8
146
85
5
552
29
17
22
30
1.96
119664096--119664130
14
2.5
14
90
0
52
20
22
2
54
1.58
119664043--119664256
88
2.4
88
82
3
261
27
19
20
33
1.96
119665309--119665343
16
2.1
16
89
10
52
71
2
0
25
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119666005--119666059
3
18.3
3
96
0
101
34
1
0
63
1.05
119668463--119668500
19
1.9
19
89
5
58
50
2
13
34
1.55
119668788--119668908
3
39.3
3
71
15
79
61
2
6
29
1.35
119668773--119668876
18
5.5
17
75
19
75
61
4
5
27
1.39
119673002--119673046
23
2.0
23
82
8
56
40
0
0
60
0.97
119673968--119674034
33
2.0
33
91
0
107
8
23
23
43
1.82
119678123--119678147
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
119679287--119679762
131
3.6
130
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5
510
27
18
19
34
1.95
119681318--119681368
18
2.7
18
80
17
50
33
5
1
58
1.33
119683447--119683633
49
3.8
49
81
7
236
27
19
24
28
1.98
119683442--119683628
100
1.9
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94
1
329
26
20
24
28
1.99
119695452--119695492
15
2.6
16
81
18
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65
4
0
29
1.13
119699671--119699806
26
5.2
26
97
0
236
33
5
24
36
1.78
119702854--119702895
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2.1
30
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6
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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20
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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28
20
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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