Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  175  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52308546--52308577
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
52312723--52312979
44
5.8
44
75
4
196
31
18
22
27
1.97
52312729--52312980
88
2.9
88
80
5
260
30
17
23
28
1.97
52313252--52313323
31
2.3
32
82
2
92
29
15
11
44
1.80
52320920--52320977
24
2.7
22
84
12
68
43
1
0
55
1.10
52321461--52321488
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
52325952--52325979
14
2.0
14
100
0
56
50
14
0
35
1.43
52332036--52332087
14
3.8
14
78
12
63
34
1
1
61
1.18
52333770--52333849
31
2.6
31
84
5
92
30
13
18
37
1.90
52335306--52335359
21
2.6
21
87
0
81
16
18
33
31
1.93
52339155--52339330
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
52339151--52339322
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
52342068--52342105
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
52342137--52342211
22
3.3
22
67
20
55
56
8
6
29
1.54
52342244--52342280
2
19.5
2
89
10
60
51
0
0
48
1.00
52342244--52342286
21
2.0
21
91
8
70
48
0
2
48
1.14
52352178--52352219
12
3.6
12
77
6
50
45
2
14
38
1.58
52358048--52358283
94
2.5
93
81
7
278
28
25
15
30
1.96
52364081--52364128
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
52364171--52364231
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
52364281--52364423
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
52364281--52364423
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52364281--52364424
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
52364614--52364676
31
2.1
31
90
3
101
36
15
23
23
1.94
52372196--52372243
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
52372286--52372346
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
52372396--52372538
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
52372396--52372538
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
52372396--52372539
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
52372730--52372792
31
2.1
31
90
3
101
36
15
23
23
1.94
52380467--52380508
17
2.4
18
84
4
50
9
11
2
76
1.12
52384086--52384290
52
3.9
52
82
4
218
31
26
17
24
1.97
52384086--52384290
104
2.0
104
81
6
245
31
26
17
24
1.97
52386350--52386472
57
2.1
58
83
4
151
30
17
21
30
1.96
52399414--52399463
23
2.2
24
89
7
77
42
38
8
12
1.71
52400505--52400537
13
2.4
14
85
15
50
0
12
15
72
1.12
52400869--52400937
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
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Number
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Size
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Percent
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A
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27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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