Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  568  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
177069781--177069805
13
1.9
13
100
0
50
32
0
20
48
1.50
177073113--177073204
29
3.2
28
85
3
112
32
16
28
22
1.96
177073115--177073194
28
2.8
28
88
1
106
33
15
27
23
1.94
177073113--177073217
29
3.7
29
79
7
106
29
16
31
22
1.96
177079264--177079331
20
3.4
20
89
0
100
36
8
20
33
1.84
177079381--177079461
24
3.4
24
91
5
128
28
20
22
28
1.99
177080522--177080546
13
1.9
13
100
0
50
32
0
20
48
1.50
177083846--177083938
29
3.2
29
87
0
123
33
16
27
22
1.95
177083846--177083951
29
3.7
29
82
5
115
30
16
31
22
1.95
177091767--177091859
29
3.2
29
87
0
123
33
16
27
22
1.95
177091767--177091872
29
3.7
29
82
5
115
30
16
31
22
1.95
177098200--177098247
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
177098295--177098350
11
5.5
11
71
16
57
35
12
19
32
1.89
177098284--177098350
20
3.3
20
93
0
116
34
11
20
32
1.90
177098419--177098457
20
2.0
20
90
5
62
25
15
20
38
1.92
177098401--177098514
24
4.9
24
81
12
114
27
21
20
31
1.98
177098707--177098770
31
2.1
31
93
0
110
37
15
23
23
1.93
177101838--177102005
40
4.2
40
80
2
187
25
27
21
25
1.99
177101829--177102005
80
2.2
80
82
3
214
25
27
21
25
1.99
177109854--177110025
40
4.3
40
81
0
202
25
26
22
25
2.00
177115392--177115585
40
4.9
40
88
1
275
25
26
22
24
2.00
177123176--177123213
17
2.4
17
91
8
62
31
13
0
55
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
177127204--177127246
19
2.3
19
80
8
52
9
18
4
67
1.36
177127512--177127657
62
2.4
60
85
5
186
28
18
28
25
1.98
177129911--177130020
40
2.8
40
85
0
148
23
26
23
26
2.00
177137965--177138074
40
2.8
40
85
0
148
23
26
23
26
2.00
177141430--177141481
27
2.0
26
84
3
68
17
23
21
38
1.93
177144697--177144967
138
2.0
138
89
1
418
16
22
13
47
1.82
177145951--177145980
13
2.2
14
94
5
53
0
16
0
83
0.65
177155858--177155886
13
2.1
14
93
6
51
41
3
20
34
1.69
177156972--177157045
28
2.6
29
93
4
132
37
0
43
18
1.51
177158021--177158075
29
1.9
28
92
3
92
20
18
29
32
1.96
177167249--177167469
94
2.3
93
90
3
361
23
28
26
20
1.99
177168357--177168406
7
7.0
7
80
13
57
26
4
2
68
1.18
177170637--177170743
39
2.7
39
85
2
142
27
20
28
24
1.99
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Size
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Number
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107
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Period
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Copy
Number
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Percent
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28
1.98

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