Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  758  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
240337343--240337424
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
240345130--240345199
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
240345130--240345211
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
240348316--240348461
40
3.7
40
77
6
120
23
29
24
22
1.99
240356418--240356566
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
240356459--240356566
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
240358257--240358292
17
2.1
17
100
0
72
16
13
33
36
1.89
240358294--240358331
18
2.1
19
90
5
60
39
28
0
31
1.57
240363614--240363780
40
4.2
40
79
2
167
22
26
23
26
2.00
240363630--240363778
80
1.9
79
84
6
203
21
27
24
26
1.99
240371540--240371707
40
4.2
40
79
3
160
23
26
23
27
2.00
240371556--240371705
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
27
1.99
240375028--240375205
40
4.5
40
89
6
240
23
23
28
24
2.00
240378043--240378090
25
2.0
23
84
8
60
75
0
16
8
1.04
240379377--240379536
29
5.5
29
82
4
180
26
16
31
25
1.97
240387458--240387617
29
5.5
29
82
4
180
26
16
31
25
1.97
240394785--240394898
51
2.2
51
95
0
201
33
14
23
28
1.94
240402516--240402640
54
2.4
51
83
4
151
32
17
20
28
1.96
240402490--240402650
51
3.1
51
79
5
187
33
16
22
27
1.96
240403532--240403578
15
2.8
16
78
15
51
57
2
0
40
1.11
240405609--240405667
29
2.0
31
83
12
79
59
6
1
32
1.34
240405648--240405725
8
10.5
8
72
21
55
65
1
0
33
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
240412486--240412673
40
4.7
40
89
1
270
26
29
20
23
1.99
240412466--240412677
80
2.7
79
87
3
309
27
28
20
23
1.99
240419201--240419406
41
5.1
39
84
6
250
27
29
20
22
1.98
240419197--240419406
81
2.6
80
87
5
298
27
29
20
22
1.99
240419217--240419406
40
4.7
39
87
5
245
26
29
21
23
1.99
240419662--240419699
17
2.2
17
100
0
76
18
23
23
34
1.96
240424398--240424520
43
2.9
41
78
9
115
34
21
16
26
1.95
240424403--240424611
44
4.8
44
76
11
155
32
23
17
26
1.96
240424895--240424934
14
2.5
17
76
19
50
35
20
2
42
1.65
240428987--240429169
39
4.7
39
85
6
235
26
21
30
21
1.98
240428984--240429169
78
2.4
79
91
3
304
25
21
30
22
1.98
240429591--240429649
29
2.0
29
100
0
118
20
20
32
27
1.97
240439034--240439106
28
2.6
29
89
6
105
26
16
31
26
1.96
240446402--240446430
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
240447054--240447127
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
240449248--240449422
46
3.8
46
76
13
196
29
29
20
21
1.98
240449256--240449429
93
1.9
93
92
0
294
28
29
20
21
1.98
240454128--240454316
29
6.5
29
92
3
299
25
24
14
35
1.93
240454128--240454316
59
3.2
59
92
3
310
25
24
14
35
1.93
240461678--240461835
29
5.5
29
93
6
277
24
24
13
37
1.92
240461678--240461865
57
3.2
58
88
6
274
25
25
13
36
1.93
240465122--240465252
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
240465122--240465252
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
240468671--240468879
40
5.2
40
87
3
296
22
28
24
25
1.99
240476731--240476940
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
240478631--240478842
47
4.5
47
87
6
313
25
31
13
29
1.93
240494660--240494724
29
2.2
29
97
0
121
29
16
27
26
1.97
240499206--240499278
28
2.5
29
84
4
94
30
28
15
26
1.96
240507065--240507166
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
240513312--240513348
18
2.0
20
89
10
60
37
2
10
48
1.52
240517330--240517489
29
5.6
29
87
3
207
25
16
31
26
1.96
240517330--240517488
86
1.8
87
83
4
214
25
16
31
26
1.96
240525180--240525244
29
2.3
28
86
2
85
32
16
27
23
1.96
240531319--240531596
27
10.3
27
84
4
319
26
18
19
35
1.95
240531318--240531596
54
5.2
54
85
0
369
26
18
19
35
1.95
240531318--240531596
81
3.4
81
84
0
378
26
18
19
35
1.95
240531873--240531910
19
2.0
19
85
10
51
23
44
21
10
1.83
240534428--240534525
28
3.5
28
86
5
119
32
26
14
26
1.94
240543429--240543557
29
4.4
29
84
1
143
25
17
31
25
1.97
240545650--240545698
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
240546516--240546682
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
240553596--240553644
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
240554462--240554611
40
3.8
39
80
7
162
26
22
27
24
1.99
240561065--240561137
29
2.6
29
82
2
94
21
34
17
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
240561007--240561136
29
4.5
28
76
5
91
23
36
16
23
1.95
240568911--240568987
29
2.7
29
91
0
127
23
31
15
29
1.95
240572820--240572928
39
2.8
39
86
5
150
24
26
22
26
2.00
240580728--240580869
38
3.6
39
83
9
157
25
26
21
26
2.00
240581571--240581617
2
23.5
2
91
8
78
48
2
0
48
1.13
240581574--240581617
15
2.9
15
96
0
79
47
2
0
50
1.13
240587553--240587715
70
2.3
71
97
1
310
34
18
28
19
1.95
240595102--240595219
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
240595070--240595233
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
240598394--240598569
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
240598390--240598561
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
240603014--240603164
40
3.8
40
77
13
134
27
23
26
22
2.00
240603051--240603180
40
3.2
40
77
4
138
24
23
27
23
2.00
240611031--240611181
40
3.8
40
77
13
134
27
23
26
22
2.00
240611068--240611197
40
3.2
40
77
4
138
24
23
27
23
2.00
240616272--240616324
26
1.9
28
85
11
74
67
5
0
26
1.12
240616428--240616471
16
3.0
15
84
12
56
0
61
0
38
0.96
240616428--240616471
13
3.0
16
87
12
60
0
61
0
38
0.96
240616951--240617025
26
2.8
28
74
15
75
25
8
0
66
1.18
240616963--240617031
8
8.1
8
70
17
50
26
5
0
68
1.12
240617510--240617548
2
19.5
2
100
0
78
48
0
0
51
1.00
240617682--240617711
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
240631358--240631427
27
2.5
28
86
2
97
32
25
14
27
1.94
240631435--240631539
40
2.6
41
93
3
176
22
33
15
28
1.95
240638585--240638715
57
2.3
58
82
4
158
25
32
16
25
1.96
240638629--240638715
29
3.0
29
98
0
165
27
28
13
29
1.94
240641590--240641664
26
2.9
25
86
4
96
40
25
17
17
1.91
240647204--240647372
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
240655188--240655356
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
240671597--240671841
49
4.9
49
81
3
292
28
26
18
25
1.98
240671613--240671841
100
2.3
98
84
3
296
29
27
17
25
1.98
240672488--240672547
30
2.0
30
83
6
77
28
25
8
38
1.84
240690910--240691089
39
4.6
39
82
8
170
27
22
26
23
2.00
240690948--240691060
40
2.9
39
88
7
158
26
22
27
23
1.99
240698811--240698981
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
240705118--240705289
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
240705111--240705286
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
240712617--240712787
93
1.8
92
94
1
306
28
29
21
21
1.98
240712610--240712784
45
3.8
46
79
13
207
29
29
21
20
1.98
240716581--240716621
20
2.0
20
85
0
55
31
21
12
34
1.91
240721276--240721387
40
2.8
40
86
4
147
25
28
21
25
1.99
240727580--240727763
79
2.3
81
82
8
218
23
27
24
24
2.00
240727573--240727763
39
4.8
39
75
10
154
23
28
24
24
2.00
240737036--240737198
39
4.2
39
91
0
263
23
33
20
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
240744967--240745129
39
4.2
39
91
0
263
23
33
20
22
1.97
240752747--240752909
70
2.3
71
97
1
310
34
18
28
19
1.95
240760213--240760408
70
2.8
70
90
4
265
33
16
29
20
1.95
240760247--240760408
70
2.3
70
96
2
299
34
17
29
19
1.94
240763916--240764068
39
3.9
39
88
0
216
24
29
20
25
1.99
240763885--240764067
78
2.3
79
89
1
269
23
28
22
25
1.99
240767125--240767219
27
3.6
26
94
2
163
29
11
27
31
1.92
240775027--240775096
27
2.5
28
93
2
115
28
14
25
31
1.95
240775027--240775108
27
3.0
27
84
8
69
29
15
23
31
1.95
240778075--240778236
39
4.2
39
91
1
254
24
33
19
22
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770