genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.609.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  609  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
190713538--190713632	24	4.0	24	87	5	131	28	21	23	27	1.99
190713823--190713917	31	3.1	31	98	0	181	38	15	22	23	1.92
190719891--190719938	25	1.9	25	86	0	69	33	25	16	25	1.96
190719982--190720040	20	3.0	20	97	0	109	37	10	20	32	1.86
190719986--190720040	11	5.4	11	70	16	55	38	10	20	30	1.87
190720091--190720209	24	5.0	24	88	5	170	28	21	22	26	1.99
190720091--190720209	47	2.5	48	89	5	170	28	21	22	26	1.99
190720400--190720493	31	3.1	31	96	1	172	39	14	22	23	1.91
190726577--190726646	27	2.6	27	95	2	122	30	27	14	28	1.95
190736331--190736447	31	3.5	35	87	11	126	22	23	16	37	1.93
190736354--190736447	31	3.1	31	96	1	172	23	22	14	39	1.91
190736639--190736781	24	6.0	24	91	4	209	26	22	22	28	1.99
190736639--190736780	47	3.0	48	90	5	207	26	22	22	28	1.99
190736638--190736781	71	2.0	72	89	4	220	26	22	22	29	1.99
190736832--190736891	20	3.0	20	95	0	111	33	20	10	36	1.86
190736832--190736886	11	5.4	11	70	16	55	30	20	10	38	1.87
190736934--190736981	25	1.9	25	86	0	69	25	16	25	33	1.96
190742873--190742923	20	2.5	20	93	0	84	35	11	21	31	1.90
190742968--190743179	24	9.0	24	88	6	301	28	23	21	27	1.99
190742969--190743179	47	4.5	47	90	5	304	28	22	21	27	1.99
190742968--190743179	71	3.0	71	91	5	333	28	23	21	27	1.99
190743373--190743466	31	3.1	31	92	1	145	36	15	23	24	1.94
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
190745781--190746242	123	3.8	123	97	0	843	29	10	25	33	1.90
190745932--190746124	64	3.1	64	60	15	150	28	10	26	34	1.90
190746211--190746414	40	5.1	40	87	0	237	24	21	26	26	1.99
190753281--190753621	123	2.8	123	96	1	625	30	9	25	34	1.88
190753586--190753769	40	4.7	40	86	4	205	26	22	26	25	2.00
190753576--190753769	78	2.5	79	83	5	216	26	21	26	25	2.00
190755488--190755567	29	2.8	28	81	7	99	22	12	35	30	1.91
190755847--190755901	27	2.1	26	86	3	74	47	21	16	14	1.82
190758277--190758314	4	9.2	4	83	16	51	23	0	2	73	0.95
190759323--190759400	29	2.8	28	73	7	77	25	15	32	26	1.95
190762216--190762305	27	3.3	27	78	6	101	34	17	24	23	1.96
190762447--190762511	27	2.4	27	79	5	69	20	20	24	35	1.96
190763823--190763916	27	3.5	28	75	5	86	36	19	22	22	1.95
190764056--190764120	27	2.4	27	79	5	69	20	20	24	35	1.96
190764306--190764370	33	2.0	33	93	0	112	26	18	24	30	1.98
190769934--190770117	40	4.6	39	75	6	138	26	23	27	22	2.00
190769974--190770162	80	2.4	81	77	4	186	23	24	29	22	1.99
190783252--190783419	40	4.2	40	80	4	169	23	27	23	25	2.00
190788652--190788810	43	3.7	43	80	7	171	30	27	19	23	1.98
190788655--190788811	86	1.8	85	85	6	219	30	27	19	22	1.98
190790768--190790939	67	2.6	66	81	7	170	31	16	29	22	1.96
190790792--190790975	67	2.8	64	78	8	203	28	16	30	23	1.96
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
190798474--190798532	30	2.0	29	86	3	82	28	25	8	37	1.85
190801513--190801722	40	5.2	40	88	2	305	21	28	24	25	1.99
190809645--190809852	79	2.6	78	87	3	283	22	28	23	25	1.99
190809645--190809852	40	5.2	40	87	3	287	22	28	23	25	1.99
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190825999--190826595	80	7.4	81	80	2	610	39	20	18	21	1.92
190832056--190832156	27	3.7	28	77	6	91	39	19	8	31	1.83
190832151--190832443	27	10.9	27	86	4	351	27	21	8	42	1.82
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190832232--190832479	81	3.1	81	83	4	180	29	20	8	40	1.83
190832421--190832588	54	3.1	54	79	8	155	39	22	8	29	1.83
190832436--190832590	81	1.9	81	85	7	217	40	21	9	29	1.84
190832599--190832650	27	1.9	27	84	7	70	40	9	11	38	1.74
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190837679--190837817	53	2.6	54	84	5	183	38	23	7	30	1.83
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190842939--190843062	27	4.7	26	85	5	160	41	20	6	30	1.78
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190855052--190855249	71	2.8	70	92	3	276	20	28	17	33	1.95
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190873029--190873212	27	6.8	27	85	0	206	38	16	16	28	1.90
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
190873027--190873216	54	3.5	54	83	0	236	38	16	15	28	1.90
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190873329--190873362	17	1.9	17	88	5	50	14	44	29	11	1.81
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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