Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  312  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95307243--95307404
46
3.5
46
81
7
152
23
28
19
29
1.98
95312088--95312137
19
2.6
19
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6
75
56
4
16
24
1.57
95317110--95317161
20
2.6
20
90
0
77
15
32
30
21
1.94
95326046--95326094
19
2.6
18
87
6
62
48
0
10
40
1.37
95326233--95326268
14
2.6
14
86
0
54
25
8
5
61
1.46
95338529--95338578
26
1.9
26
91
0
82
42
4
16
38
1.66
95343740--95343789
26
1.9
26
95
0
91
46
2
14
38
1.56
95345845--95345894
26
1.9
26
95
0
91
46
2
14
38
1.56
95347945--95347994
26
1.9
26
95
0
91
46
2
14
38
1.56
95353001--95353103
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
95356635--95356684
26
1.9
26
95
0
91
46
2
14
38
1.56
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13.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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9
170
27
23
24
24
2.00
95358982--95359138
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2.0
79
80
7
176
29
23
22
23
1.99
95366273--95366298
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
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79
2.2
81
84
4
227
26
23
25
24
2.00
95367007--95367184
40
4.5
39
81
7
180
26
23
25
24
2.00
95367128--95367210
40
2.1
40
81
4
96
26
26
26
20
1.99
95368653--95368805
32
4.8
32
85
0
216
32
12
8
46
1.72
95368653--95368805
64
2.4
64
92
0
252
32
12
8
46
1.72
95372328--95372383
21
2.7
21
97
0
103
28
35
8
26
1.87
95374203--95374238
9
4.0
9
96
0
63
47
0
0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95377112--95377262
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
95384628--95384778
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
95388495--95388654
29
5.5
30
88
8
222
27
25
13
33
1.94
95388495--95388654
59
2.8
57
89
4
223
27
25
13
33
1.94
95395966--95396124
30
5.5
29
85
8
198
27
24
14
33
1.94
95395966--95396095
28
4.6
27
80
13
145
26
23
14
34
1.94
95395966--95396124
58
2.8
56
81
6
176
27
24
14
33
1.94
95399803--95399864
30
2.1
30
100
0
124
32
3
37
27
1.73
95400875--95401592
27
26.7
27
86
1
845
36
18
18
26
1.94
95400875--95401676
54
15.1
54
84
7
902
36
18
18
26
1.94
95400875--95401679
81
10.1
81
83
6
905
36
18
18
26
1.94
95401575--95401609
17
2.1
17
100
0
70
28
28
11
31
1.92
95401553--95401636
44
1.9
44
87
4
125
32
21
19
27
1.97
95401597--95401676
27
3.0
27
87
7
117
35
18
22
23
1.96
95401522--95401663
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22
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30
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3.6
31
88
0
150
19
18
14
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1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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53
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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100
20
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30
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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