Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  414  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127409687--127409782
48
2.0
48
89
4
149
18
12
28
40
1.87
127409938--127409982
22
2.0
22
87
8
65
26
0
17
55
1.42
127415317--127415505
43
4.4
43
77
8
127
33
25
15
24
1.95
127415359--127415505
43
3.4
43
77
5
136
36
24
14
23
1.93
127419992--127420166
46
3.8
45
79
7
199
29
28
19
22
1.98
127420000--127420171
93
1.8
93
91
2
283
29
29
19
22
1.98
127419997--127420186
46
4.1
46
72
14
131
30
28
19
22
1.98
127421377--127421562
51
3.7
50
75
9
182
25
19
26
27
1.99
127421371--127421554
50
3.7
49
80
9
203
26
19
27
27
1.99
127424577--127424637
15
4.1
15
73
24
58
11
13
13
62
1.55
127424571--127424628
30
1.9
30
89
6
91
12
12
13
62
1.56
127424571--127424637
14
4.6
15
72
17
61
10
11
14
62
1.54
127426522--127426567
20
2.3
20
100
0
92
28
28
32
10
1.91
127426523--127426559
11
3.5
11
78
14
51
27
29
32
10
1.90
127426686--127426777
26
3.4
27
88
8
134
44
25
9
20
1.82
127431150--127431294
40
3.6
39
79
3
137
24
24
28
22
2.00
127431155--127431303
80
1.9
80
81
2
183
22
24
30
22
1.99
127431151--127431322
80
2.1
81
77
5
179
23
24
29
22
1.99
127434948--127435000
6
8.8
6
79
8
63
37
3
30
28
1.75
127434948--127434987
18
2.2
18
100
0
80
35
5
32
27
1.79
127436456--127436631
46
3.8
46
80
4
201
27
19
29
23
1.98
127440323--127440458
49
2.7
51
85
2
186
26
15
23
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127449401--127449457
28
2.0
28
82
0
69
29
29
8
31
1.87
127453770--127453941
93
1.8
93
96
0
317
27
29
22
21
1.99
127453763--127453943
46
3.9
46
83
9
242
27
29
21
21
1.99
127461393--127461560
46
3.7
43
80
12
165
30
20
26
22
1.98
127461393--127461611
94
2.3
94
80
6
237
30
20
27
22
1.98
127462932--127462987
21
2.7
21
97
0
103
10
33
30
25
1.90
127470609--127470796
49
3.8
49
83
2
250
27
19
25
28
1.99
127470604--127470791
100
1.9
100
96
0
349
26
20
25
28
1.99
127472222--127472422
94
2.1
94
79
5
219
29
20
27
21
1.98
127472457--127472576
49
2.4
49
86
4
152
26
20
28
24
1.99
127475306--127475365
31
1.9
31
83
12
79
36
1
18
43
1.60
127475534--127475671
49
2.7
51
85
2
190
26
15
23
34
1.95
127478594--127478631
12
3.2
12
82
17
53
76
0
10
13
1.02
127480685--127480730
23
2.0
23
100
0
92
30
17
13
39
1.87
127489231--127489301
29
2.5
29
88
4
92
28
29
14
28
1.95
127490632--127490671
16
2.3
18
83
12
57
15
15
0
70
1.18
127498871--127499014
39
3.7
40
89
0
175
23
31
21
22
1.98
127498901--127499014
39
2.9
39
94
1
192
24
32
20
22
1.98
127506915--127507058
39
3.7
40
89
0
175
23
31
21
22
1.98
127506945--127507058
39
2.9
39
94
1
192
24
32
20
22
1.98
127511261--127511485
40
5.6
40
85
3
290
23
23
27
25
2.00
127511261--127511485
83
2.8
79
86
6
324
23
23
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127527394--127527423
13
2.3
13
100
0
60
56
13
0
30
1.37
127545682--127545782
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
127550367--127550435
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
127552222--127552265
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34
127554648--127554716
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
127556505--127556548
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34
127558893--127558961
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
127567502--127567544
15
3.2
15
69
30
51
65
0
6
27
1.18
127567495--127567544
25
2.0
25
100
0
100
64
0
8
28
1.22
127573172--127573245
33
2.3
33
86
6
100
44
4
0
51
1.20
127573238--127573457
11
21.4
10
69
24
97
65
2
2
29
1.21
127573287--127573367
22
3.4
24
82
17
114
69
3
3
23
1.21
127573355--127573409
13
4.4
13
93
2
87
67
0
0
32
0.91
127573361--127573457
15
6.7
15
75
12
78
63
0
3
32
1.10
127573304--127573467
43
3.7
42
74
16
118
66
1
3
28
1.16
127573263--127573459
49
4.0
50
75
14
139
65
2
3
28
1.21
127573403--127573506
20
5.4
20
69
21
62
59
0
5
33
1.28
127573305--127573465
13
11.8
14
66
26
55
66
1
3
28
1.16
127573481--127573564
26
3.6
23
69
13
64
53
3
0
42
1.18
127573485--127573573
23
3.7
26
71
13
82
51
4
1
42
1.29
127579212--127579242
15
2.1
15
100
0
62
19
12
0
67
1.22
127579917--127579950
16
2.1
17
94
5
61
64
0
11
23
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127580851--127580912
16
4.0
15
74
13
54
20
9
11
58
1.61
127580869--127580919
16
3.2
16
97
0
93
21
11
13
52
1.72
127582237--127582270
14
2.4
14
90
5
50
67
0
17
14
1.23
127583541--127583629
9
10.3
9
70
20
57
59
0
2
38
1.10
127583537--127583594
19
3.1
19
83
11
68
65
0
0
34
0.93
127583510--127583651
34
4.1
35
75
15
109
60
0
3
35
1.19
127583533--127583651
24
4.9
24
76
11
109
61
0
2
36
1.10
127583587--127583622
15
2.3
16
95
4
65
55
0
5
38
1.23
127583533--127583672
23
6.2
22
74
17
85
60
0
2
36
1.11
127584060--127584086
13
2.1
13
100
0
54
48
0
7
44
1.31
127584247--127584296
19
2.5
21
84
9
70
36
2
0
62
1.07
127584373--127584411
17
2.3
17
86
8
53
23
2
5
69
1.21
127584547--127584578
15
2.0
17
88
11
50
31
3
9
56
1.47
127585201--127585243
18
2.4
18
88
0
59
69
6
13
9
1.35
127589967--127589997
15
2.1
15
100
0
62
12
19
19
48
1.81
127593413--127593496
20
4.4
19
73
23
70
33
5
1
59
1.29
127593418--127593467
16
2.8
17
85
11
57
36
8
0
56
1.29
127595201--127595237
18
2.1
18
89
0
56
54
0
24
21
1.45
127598090--127598123
17
2.0
17
94
0
59
38
2
11
47
1.55
127607094--127607146
24
2.2
25
86
10
74
41
0
0
58
0.98
127607093--127607162
24
3.0
23
73
20
65
41
0
0
58
0.98
127607127--127607162
15
2.5
14
86
8
54
41
0
0
58
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127607334--127607372
21
1.9
21
94
5
71
30
25
10
33
1.89
127609899--127609923
12
2.1
12
100
0
50
44
0
8
48
1.32
127621658--127621697
13
2.8
15
85
14
66
35
0
0
65
0.93
127626013--127626160
80
1.9
80
80
4
174
22
30
24
22
1.99
127626053--127626160
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
127634124--127634272
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
127634165--127634272
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
127637757--127637824
34
2.0
34
97
0
127
41
25
2
30
1.70
127639143--127639282
27
5.2
27
91
0
201
40
22
13
22
1.89
127643820--127644077
27
9.6
27
75
4
180
43
18
13
23
1.86
127643820--127644079
54
4.8
54
77
2
229
43
18
14
23
1.87
127643820--127644079
81
3.2
81
79
5
247
43
18
14
23
1.87
127645402--127645429
12
2.3
12
100
0
56
28
46
0
25
1.53
127646961--127647055
48
2.0
48
100
0
190
51
16
10
21
1.74
127646973--127647075
48
2.2
48
85
1
136
54
15
10
19
1.70
127648579--127648686
36
3.0
36
97
0
198
34
25
16
23
1.95
127650510--127650555
16
2.9
16
83
3
58
6
19
23
50
1.71
127654879--127654922
5
9.0
5
82
2
54
56
0
6
36
1.26
127661159--127661292
40
3.3
41
87
4
175
32
27
17
23
1.96
127668151--127668323
47
3.7
47
93
0
283
28
31
6
32
1.84
127668226--127668301
22
3.3
22
67
16
64
27
31
10
30
1.90
127680836--127680876
13
3.0
14
79
13
50
31
0
0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127681852--127681888
19
1.9
19
100
0
74
32
21
18
27
1.97
127685231--127685392
71
2.3
69
97
2
306
35
17
27
19
1.94
127692084--127692186
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
127700084--127700186
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
127711770--127712167
55
7.5
53
74
9
258
24
22
17
35
1.95
127711770--127712167
109
3.7
109
77
8
433
24
22
17
35
1.95
127711890--127712206
100
3.1
101
74
12
329
25
22
15
35
1.94
127711782--127712206
209
2.0
209
92
0
699
24
23
16
35
1.95
127712345--127712431
44
2.0
44
81
4
104
21
26
14
36
1.93
127715655--127715718
19
3.4
19
75
0
65
42
1
3
53
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770