Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  729  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
230660010--230660169
26
5.9
26
78
11
160
37
0
60
1
1.09
230659979--230660169
14
13.4
14
72
16
124
38
0
59
1
1.11
230660509--230660616
26
4.2
26
90
0
171
32
6
23
37
1.80
230665997--230666037
17
2.4
17
87
0
64
39
17
9
34
1.82
230669412--230669494
26
3.2
26
96
0
148
32
4
25
37
1.77
230679463--230679607
40
3.6
40
84
4
184
23
24
24
26
2.00
230680622--230680827
43
4.9
43
91
6
350
23
18
33
23
1.97
230680624--230680844
82
2.6
84
88
5
340
23
19
32
24
1.97
230680897--230680961
30
2.2
30
82
0
76
61
18
4
15
1.50
230686839--230686950
57
2.0
57
89
0
170
29
0
23
46
1.58
230686851--230686963
9
12.2
9
79
5
118
30
0
21
46
1.57
230686839--230686963
57
2.2
57
86
0
169
30
0
21
47
1.57
230687007--230687917
240
3.8
240
98
0
1723
32
13
18
35
1.90
230687007--230687917
481
1.9
481
97
0
1732
32
13
18
35
1.90
230687962--230688012
10
5.4
10
75
13
54
35
17
0
47
1.48
230687955--230688008
27
2.0
27
100
0
108
40
14
0
44
1.46
230688056--230688104
23
2.1
23
92
7
82
36
16
14
32
1.89
230691563--230691616
19
2.8
19
91
0
90
22
24
29
24
1.99
230691634--230691685
19
2.7
20
84
6
70
32
1
38
26
1.68
230692642--230692685
15
3.0
14
90
6
61
31
2
20
45
1.64
230692856--230692911
29
1.9
29
92
0
94
19
8
35
35
1.83
230693434--230693650
81
2.7
81
82
5
260
23
21
19
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
230693434--230693650
41
5.4
39
81
7
197
23
21
19
35
1.96
230702768--230702991
79
2.8
79
85
8
303
24
21
27
26
2.00
230702768--230702991
40
5.7
39
88
7
294
24
21
27
26
2.00
230702775--230703024
79
3.2
78
82
12
287
26
20
26
26
1.99
230706825--230706906
29
2.8
29
98
0
155
29
14
30
25
1.95
230714690--230714771
29
2.8
29
98
0
155
29
14
30
25
1.95
230717475--230717515
21
2.0
21
90
9
66
0
53
17
29
1.44
230717923--230717951
14
2.1
14
93
6
51
58
6
0
34
1.25
230718116--230718154
17
2.4
17
86
4
53
48
0
10
41
1.37
230723127--230723316
9
20.6
9
70
13
91
38
1
13
46
1.52
230723114--230723266
34
4.0
40
69
21
130
40
0
11
47
1.45
230723126--230723289
71
2.3
69
84
4
204
39
1
12
46
1.49
230723163--230723309
44
3.4
44
76
17
153
38
2
12
46
1.53
230723163--230723347
96
2.0
91
86
9
261
38
2
11
47
1.53
230723103--230723316
114
1.9
114
84
5
290
38
1
13
46
1.51
230723421--230723476
15
3.8
15
76
21
64
51
0
1
46
1.11
230723686--230724361
273
2.5
275
98
0
1302
36
13
13
36
1.85
230724842--230725209
183
2.0
183
96
0
682
42
15
15
26
1.86
230725281--230725310
14
2.2
13
94
5
51
36
13
0
50
1.42
230728052--230728154
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
230736069--230736171
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
230740344--230740444
29
3.5
29
78
6
107
29
14
27
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
230748163--230748263
29
3.5
29
78
6
107
29
14
27
27
1.96
230758496--230758716
38
5.7
38
83
6
239
24
21
27
26
1.99
230762496--230762644
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
230762537--230762644
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
230771090--230771138
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
230771960--230772126
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
230779096--230779144
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
230779966--230780132
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
230781434--230781549
57
2.0
57
100
0
232
11
23
34
31
1.90
230784796--230784958
39
4.2
39
91
0
263
22
20
33
23
1.97
230784796--230784988
39
4.9
39
89
1
253
22
21
32
23
1.98
230784813--230785026
78
2.7
78
84
5
218
23
22
31
22
1.99
230802542--230802713
93
1.8
93
93
0
299
27
29
22
21
1.99
230802535--230802710
46
3.8
46
78
12
198
28
28
21
21
1.98
230802586--230802729
46
3.1
44
75
15
132
28
28
20
22
1.99
230805401--230805446
18
2.6
18
77
22
60
23
8
23
43
1.82
230807123--230807195
29
2.5
29
90
0
92
24
31
16
27
1.96
230808367--230808423
25
2.3
24
84
6
69
7
15
1
75
1.10
230815019--230815091
29
2.5
29
90
0
92
24
31
16
27
1.96
230817477--230817523
23
2.0
23
95
0
85
21
19
10
48
1.78
230819899--230819938
21
1.9
21
94
0
71
30
10
12
47
1.74
230828119--230828286
40
4.2
40
79
4
151
24
27
23
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
230829513--230829549
18
2.1
18
90
5
58
0
13
5
81
0.86
230836149--230836316
40
4.2
40
79
4
151
24
27
23
25
2.00
230838020--230838128
27
4.0
27
82
10
125
36
22
25
15
1.93
230845344--230845455
27
4.2
26
85
7
143
37
23
24
15
1.93
230845344--230845455
54
2.1
54
88
3
163
37
23
24
15
1.93
230850296--230850561
46
5.7
46
74
15
242
22
20
27
29
1.99
230850342--230850510
47
3.6
47
78
16
215
23
20
27
29
1.98
230850293--230850556
93
2.8
93
94
0
456
22
20
27
29
1.99
230853486--230853541
15
3.7
15
83
7
78
12
17
10
58
1.61
230854559--230854862
41
7.4
41
87
1
416
35
22
23
19
1.96
230855023--230855056
14
2.4
15
85
14
54
32
0
23
44
1.54
230858769--230858974
70
3.1
70
65
25
197
19
10
18
50
1.76
230858743--230858993
132
1.9
133
97
1
479
19
9
18
51
1.74
230860984--230861023
21
1.9
21
94
0
71
30
10
12
47
1.74
230862680--230862747
24
2.8
24
86
8
102
27
19
7
45
1.76
230862924--230862979
15
3.8
15
80
20
73
46
0
0
53
1.00
230863084--230863309
9
24.6
9
76
8
143
47
12
0
38
1.48
230863084--230863309
18
12.3
18
75
9
161
47
12
0
38
1.48
230863112--230863333
114
1.9
114
86
3
313
47
12
0
38
1.48
230868960--230869010
21
2.4
21
80
0
66
29
19
49
1
1.60
230869260--230869326
31
2.2
31
83
0
80
17
4
17
59
1.53
230869377--230869534
41
3.8
40
90
5
221
24
31
20
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
230869399--230869534
41
3.3
41
95
4
240
23
34
19
22
1.97
230872664--230872744
43
1.9
43
87
2
119
27
17
24
30
1.97
230874398--230874779
80
4.8
80
95
0
660
28
23
21
25
1.99
230874398--230874763
40
9.2
40
90
3
560
28
24
21
25
1.99
230878750--230878848
28
3.6
28
82
8
114
29
14
27
29
1.95
230878751--230878859
55
2.0
55
81
3
130
29
14
24
31
1.95
230881658--230881824
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
230889652--230889819
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
230898777--230898925
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
230898818--230898925
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
230900772--230900809
14
2.7
14
100
0
76
21
7
13
57
1.60
230904131--230904272
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
230904170--230904298
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
230907963--230908129
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
230911783--230911924
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
230911822--230911950
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
230915554--230915671
31
3.5
35
89
9
135
22
23
16
37
1.94
230915577--230915671
31
3.1
31
98
0
181
23
22
15
38
1.92
230915863--230915981
24
5.0
24
89
5
170
26
22
21
28
1.99
230915863--230915981
47
2.5
48
89
5
170
26
22
21
28
1.99
230916032--230916069
19
2.0
19
100
0
76
31
21
10
36
1.87
230916113--230916160
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
230923676--230923769
31
3.1
31
96
1
172
23
21
15
39
1.92
230923961--230924079
24
5.0
24
89
5
170
26
22
21
28
1.99
230923961--230924079
47
2.5
48
89
5
170
26
22
21
28
1.99
230924130--230924189
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
230924130--230924184
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87
230924232--230924279
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
230926526--230926585
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
230933241--230933370
40
3.2
40
77
13
142
24
26
24
23
2.00
230933257--230933408
40
3.8
40
79
8
132
22
26
23
26
2.00
230938099--230938224
39
3.2
38
83
5
130
26
22
28
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770