Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  382  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117700375--117700620
65
3.7
67
83
12
305
37
23
15
24
1.93
117700573--117700671
51
1.9
52
83
2
128
41
20
12
26
1.87
117700662--117700883
70
3.1
71
82
7
308
38
22
14
24
1.92
117700217--117701049
256
3.3
253
93
5
1380
36
23
14
25
1.93
117706020--117706055
12
3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
117707988--117708043
25
2.2
25
78
6
60
50
3
5
41
1.43
117708013--117708111
39
2.6
38
77
6
103
54
4
6
35
1.44
117708570--117708629
28
2.2
28
87
3
86
5
5
20
70
1.26
117709676--117709726
19
2.6
19
81
9
59
35
1
5
56
1.35
117711204--117711244
17
2.6
16
85
11
50
58
7
9
24
1.55
117714267--117714311
17
2.4
18
82
17
56
55
11
6
26
1.59
117714670--117714717
3
16.0
3
91
8
80
66
0
0
33
0.92
117714659--117714725
12
4.9
14
83
12
61
65
1
1
31
1.10
117715324--117715375
22
2.3
23
83
9
63
78
1
9
9
1.03
117715326--117715402
32
2.4
31
76
21
79
77
1
12
7
1.03
117716590--117716640
21
2.5
21
84
12
63
41
1
1
54
1.22
117721220--117721268
3
16.3
3
100
0
98
67
0
0
32
0.91
117722096--117722159
35
1.9
32
87
9
92
21
12
48
17
1.80
117722790--117723098
88
3.5
88
79
5
248
36
18
16
28
1.92
117722877--117723098
88
2.5
90
82
4
261
34
18
17
29
1.94
117723212--117723347
72
1.9
72
93
0
236
30
26
18
25
1.98
117723314--117723418
54
1.9
54
88
3
158
37
20
16
26
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117723242--117723472
127
1.8
126
90
2
374
31
24
16
27
1.97
117723493--117723712
75
2.9
75
88
4
345
30
24
17
27
1.97
117723715--117723745
16
1.9
16
93
0
53
67
6
9
16
1.39
117723492--117725049
162
10.0
153
76
13
954
33
19
17
29
1.95
117723801--117723835
14
2.5
14
95
0
61
60
5
17
17
1.55
117723639--117723903
87
3.0
85
80
11
302
39
19
16
24
1.92
117723819--117724251
72
6.0
72
91
1
672
34
18
16
30
1.93
117723819--117724251
145
3.0
143
91
2
670
34
18
16
30
1.93
117724334--117724369
14
2.6
14
86
0
54
55
5
22
16
1.62
117724255--117724424
95
1.8
92
84
6
225
36
17
17
28
1.93
117724528--117725222
147
4.5
149
80
13
687
33
20
17
29
1.95
117724521--117725044
74
6.9
74
70
14
357
31
20
18
30
1.96
117724739--117724767
14
2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
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117724667--117724842
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14
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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