Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  534  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
165953691--165953858
40
4.2
40
85
5
198
26
27
22
23
1.99
165953691--165953858
80
2.1
80
86
4
232
26
27
22
23
1.99
165961396--165961563
40
4.2
40
85
5
198
26
27
22
23
1.99
165961396--165961563
80
2.1
80
86
4
232
26
27
22
23
1.99
165965398--165965636
47
5.1
47
91
1
374
31
11
29
26
1.92
165965470--165965545
22
3.3
22
68
22
66
31
11
30
26
1.92
165965595--165965741
50
3.0
50
89
3
226
38
8
23
29
1.84
165965777--165965805
14
2.1
14
100
0
58
24
13
6
55
1.63
165973227--165973394
40
4.2
40
84
5
189
26
27
22
23
1.99
165973227--165973394
80
2.1
80
85
4
223
26
27
22
23
1.99
165977231--165977469
47
5.1
47
91
2
367
31
11
30
26
1.92
165977303--165977378
22
3.3
22
68
22
66
31
11
30
26
1.92
165977428--165977574
50
3.0
50
89
3
226
38
8
24
29
1.84
165977724--165977831
37
2.9
37
94
0
180
23
18
31
26
1.97
165979691--165979842
79
1.9
80
82
6
193
25
22
28
23
1.99
165979691--165979835
40
3.7
40
79
7
170
25
22
27
24
2.00
165985154--165985346
39
4.9
39
90
0
251
23
31
21
23
1.98
165985184--165985346
39
4.2
39
93
0
263
24
31
20
23
1.98
165992934--165993079
39
3.7
40
89
0
179
24
31
21
22
1.98
165992964--165993087
39
3.2
39
95
1
212
25
32
19
22
1.97
165994655--165994717
31
2.0
31
100
0
126
50
20
9
19
1.74
165997280--165997382
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
166005276--166005378
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
166011366--166011531
27
6.1
27
82
2
172
16
24
22
35
1.95
166011366--166011531
54
3.1
54
90
1
244
16
24
22
35
1.95
166011366--166011524
81
2.0
81
86
5
223
17
25
22
35
1.95
166018396--166018561
27
6.1
27
82
2
181
16
24
22
36
1.95
166018396--166018561
54
3.1
54
92
1
262
16
24
22
36
1.95
166018396--166018561
81
2.0
81
86
4
228
16
24
22
36
1.95
166022155--166022229
33
2.3
33
86
4
107
26
22
17
33
1.96
166023739--166023926
39
4.8
39
88
0
223
23
30
21
23
1.99
166023775--166023927
39
3.9
39
92
0
243
23
31
20
24
1.98
166023744--166023926
78
2.3
79
88
1
260
22
30
22
24
1.99
166026557--166026581
11
2.3
11
100
0
50
68
0
0
32
0.90
166030247--166030722
123
3.8
123
88
8
711
30
10
25
33
1.90
166030496--166030526
15
2.1
15
100
0
62
32
0
32
35
1.58
166030725--166030934
40
5.2
40
90
1
287
23
20
27
28
1.99
166037167--166037505
123
2.8
123
95
0
597
30
10
25
33
1.90
166037474--166037716
40
6.1
40
87
2
292
24
20
26
27
1.99
166037474--166037716
79
3.0
80
86
3
303
24
20
26
27
1.99
166037474--166037716
119
2.0
120
84
2
310
24
20
26
27
1.99
166040799--166040901
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
166048823--166048925
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
166050676--166050728
26
2.0
26
96
0
97
47
20
22
9
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
166052959--166053142
40
4.6
39
79
10
187
24
22
28
24
2.00
166052958--166053140
79
2.3
81
82
7
223
25
22
27
24
2.00
166052958--166053175
79
2.7
78
75
12
203
26
21
27
24
1.99
166058026--166058077
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
166063410--166063494
31
2.8
31
87
1
136
23
25
17
32
1.97
166063713--166063782
25
2.8
25
93
0
113
25
21
25
27
1.99
166063830--166063868
11
3.7
11
80
13
55
30
17
12
38
1.88
166065902--166065947
3
15.3
3
100
0
92
65
0
0
34
0.93
166068215--166068284
25
2.8
25
95
0
122
25
22
25
25
2.00
166068332--166068380
11
4.7
11
78
12
50
30
18
12
38
1.87
166070497--166070539
3
14.3
3
100
0
86
65
0
0
34
0.93
166072069--166072176
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
166073808--166073956
27
5.6
27
78
7
153
19
24
20
34
1.96
166073801--166073956
54
2.9
53
86
2
197
19
23
21
35
1.96
166075883--166076080
40
4.9
40
87
3
249
27
20
26
26
1.99
166090568--166090817
40
6.2
40
91
1
385
22
28
24
25
1.99
166099007--166099134
47
2.8
45
83
9
159
28
19
28
22
1.98
166099007--166099277
46
5.8
48
78
8
231
28
18
29
23
1.98
166099007--166099278
94
2.9
95
78
8
272
28
18
29
23
1.98
166105257--166105316
30
2.0
30
90
0
93
28
25
8
38
1.84
166110531--166110572
21
2.0
21
85
0
57
21
16
42
19
1.89
166115230--166115267
19
2.0
19
100
0
76
31
10
10
47
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
166117148--166117248
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
166125102--166125202
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
166131431--166131580
41
3.6
41
77
10
162
22
22
28
27
1.99
166131411--166131580
41
4.2
40
74
18
161
22
22
27
27
1.99
166136986--166137142
39
4.0
39
92
0
233
26
19
31
22
1.98
166142408--166142435
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
166142704--166142745
2
21.0
2
100
0
84
50
0
0
50
1.00
166146134--166146279
48
3.0
48
96
0
265
33
6
29
30
1.82
166146420--166146522
37
2.8
37
96
0
188
23
20
32
24
1.98
166148615--166148676
31
2.0
31
90
6
99
35
14
20
29
1.93
166156581--166156642
31
2.0
31
90
6
99
35
14
20
29
1.93
166159365--166159630
47
5.7
46
74
10
177
25
21
30
22
1.99
166162677--166162884
40
5.2
40
86
0
236
25
22
26
25
2.00
166162679--166162884
80
2.6
80
85
1
261
25
22
26
25
2.00
166177162--166177291
40
3.2
40
83
4
165
23
29
25
22
1.99
166181775--166181844
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
166181775--166181856
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
166185055--166185100
11
4.2
11
91
0
74
34
6
2
56
1.37
166196039--166196160
47
2.6
46
89
2
181
34
13
25
26
1.93
166196134--166196376
54
4.5
54
85
5
294
37
16
24
22
1.93
166196150--166196411
108
2.4
109
82
4
273
37
16
24
22
1.93
166202301--166202421
47
2.6
46
86
2
170
36
14
24
24
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
166202401--166202638
54
4.4
54
82
3
264
36
16
24
21
1.94
166202400--166202651
108
2.3
108
82
2
301
36
17
24
22
1.94
166202463--166202673
108
2.0
109
81
3
257
36
16
24
22
1.94
166205430--166205504
29
2.6
29
89
4
107
26
16
32
25
1.96
166213333--166213407
29
2.6
29
89
4
107
26
16
32
25
1.96
166215852--166215893
15
2.7
15
88
3
57
42
4
0
52
1.22
166217407--166217487
40
2.0
40
95
0
144
30
20
20
27
1.98
166218727--166218890
84
2.0
84
89
2
251
27
23
12
36
1.91
166219262--166219300
7
5.6
7
84
0
51
43
33
2
20
1.65
166219321--166219352
14
2.3
14
94
0
55
46
43
0
9
1.35
166219641--166219673
14
2.4
14
94
0
57
51
24
0
24
1.48
166219832--166219915
41
2.0
41
93
4
143
21
21
23
33
1.97
166219918--166220044
41
3.1
40
83
7
157
19
26
19
33
1.96
166229876--166229941
19
3.2
21
87
6
64
36
19
9
34
1.84
166229893--166229990
19
5.2
19
90
7
155
34
16
11
37
1.84
166229893--166229990
36
2.6
37
88
9
144
34
16
11
37
1.84
166230548--166230643
43
2.2
43
92
0
165
29
32
16
21
1.96
166230615--166230671
28
2.0
28
89
0
87
19
33
17
29
1.95
166230572--166230714
71
2.0
71
87
2
207
25
32
17
25
1.97
166232428--166232513
27
3.2
27
85
8
104
36
23
23
17
1.95
166234130--166234239
26
4.2
27
88
6
147
37
24
4
33
1.76
166241489--166241744
128
2.0
131
88
3
385
35
17
19
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
166243662--166243783
42
2.9
43
87
2
192
39
19
19
21
1.93
166243662--166243961
85
3.5
86
79
4
225
31
19
20
29
1.97
166243792--166243964
43
4.0
43
87
5
244
26
17
19
36
1.94
166249845--166249881
18
2.1
18
89
0
56
27
2
27
43
1.68
166250290--166250621
183
1.8
183
97
0
637
41
13
16
28
1.86
166250717--166250758
15
2.7
16
82
14
52
42
4
0
52
1.22
166252276--166252355
39
2.0
40
97
2
153
30
21
22
26
1.99
166253594--166253753
80
2.0
80
87
4
232
27
22
13
36
1.92
166254125--166254163
7
5.6
7
84
0
51
43
33
2
20
1.65
166254184--166254215
14
2.3
14
94
0
55
46
43
0
9
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770