Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  344  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
105602709--105602868
58
2.8
58
79
0
167
23
33
16
27
1.95
105602738--105602869
29
4.6
29
89
0
156
23
31
15
29
1.96
105603514--105603808
143
2.1
141
96
1
545
38
29
10
21
1.86
105609798--105609832
18
2.1
16
89
10
52
31
17
0
51
1.45
105615332--105615512
40
4.6
40
82
4
224
25
23
27
24
2.00
105619281--105619444
71
2.3
71
98
0
319
35
17
27
18
1.94
105622756--105622831
29
2.6
29
85
0
107
32
27
21
18
1.96
105627474--105627521
24
2.0
24
95
0
87
41
22
16
18
1.90
105639517--105639591
25
3.0
25
86
0
105
26
20
25
28
1.99
105642437--105642662
40
5.7
40
87
4
287
27
25
20
26
1.99
105650509--105650719
78
2.7
79
91
2
336
28
26
20
24
1.99
105650509--105650738
118
1.9
119
87
5
340
28
25
20
25
1.99
105650509--105650719
40
5.3
40
91
3
338
28
26
20
24
1.99
105650724--105650750
11
2.5
11
100
0
54
25
18
25
29
1.98
105653811--105653875
34
1.9
34
87
6
96
29
16
24
29
1.97
105656517--105656787
47
5.8
46
76
8
217
26
18
30
23
1.97
105656519--105656788
94
2.9
93
80
8
291
27
18
30
24
1.97
105656515--105656787
140
1.9
141
82
3
345
26
17
31
24
1.97
105658989--105659172
50
3.7
49
76
7
165
24
17
28
29
1.98
105667092--105667349
46
5.5
46
76
9
202
27
17
29
25
1.97
105667134--105667358
93
2.4
92
80
8
231
27
17
29
25
1.97
105671877--105671968
43
2.2
43
83
13
111
30
29
16
23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
105674150--105674188
20
2.0
20
89
0
60
48
2
12
35
1.55
105677371--105677448
41
1.9
41
91
0
129
26
26
15
30
1.96
105679270--105679365
42
2.3
41
83
3
122
30
20
19
29
1.97
105679259--105679360
40
2.5
40
83
3
132
28
21
20
29
1.98
105684128--105684303
46
3.8
45
78
12
196
22
19
27
30
1.98
105684125--105684296
93
1.8
93
92
0
290
23
20
27
29
1.99
105690768--105690918
40
3.8
40
77
13
134
27
23
26
22
2.00
105690805--105690934
40
3.2
40
77
4
138
24
23
27
23
2.00
105698761--105698909
40
3.8
38
78
12
133
26
23
26
22
2.00
105701556--105701727
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
105701548--105701723
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
105704108--105704196
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
105704108--105704187
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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20
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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