Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  291  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88732371--88732400
15
2.0
15
93
0
51
36
0
13
50
1.42
88732709--88732816
45
2.5
43
82
7
130
23
17
28
30
1.97
88742295--88742449
42
3.7
41
84
3
193
29
17
24
28
1.97
88746947--88746997
24
2.1
24
100
0
102
39
13
19
27
1.90
88754270--88754340
21
3.3
20
78
9
61
35
0
5
59
1.21
88757126--88757333
40
5.2
40
81
3
222
25
26
22
25
2.00
88762923--88762962
19
2.1
19
100
0
80
30
22
12
35
1.91
88769106--88769223
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
88769074--88769237
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
88779775--88779903
47
2.7
47
86
0
168
23
16
27
33
1.95
88786167--88786277
56
1.9
58
83
3
145
28
29
14
27
1.95
88786176--88786289
29
4.0
29
82
8
128
28
28
14
28
1.95
88787774--88787825
16
3.2
16
88
2
68
11
3
30
53
1.54
88789803--88789828
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
88793191--88793464
135
2.0
135
99
0
539
39
18
13
28
1.89
88794238--88794275
17
2.1
19
90
9
62
31
18
10
39
1.85
88796200--88796246
3
16.3
3
78
8
53
38
0
2
59
1.09
88796246--88796274
15
1.9
15
100
0
58
65
0
0
34
0.93
88796242--88796321
26
3.1
26
69
8
74
57
1
0
41
1.07
88798395--88798463
24
3.0
23
75
10
79
24
15
14
44
1.84
88808007--88808142
40
3.4
40
78
4
105
33
26
22
18
1.97
88815259--88815428
47
3.7
46
76
11
150
24
28
18
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88819047--88819095
21
2.3
21
89
0
71
18
16
12
53
1.73
88826532--88826565
18
1.9
17
88
5
50
55
5
0
38
1.24
88827413--88827443
12
2.7
11
90
9
53
29
0
0
70
0.87
88827424--88827484
31
2.0
30
93
3
104
31
1
9
57
1.41
88829582--88829619
19
2.0
20
84
5
51
34
0
18
47
1.49
88835504--88835541
19
2.0
20
89
5
60
76
2
2
18
1.02
88844835--88845001
46
3.6
48
79
6
166
24
28
17
29
1.98
88847237--88847279
21
2.0
21
100
0
86
53
4
18
23
1.63
88847950--88848054
44
2.5
40
85
11
156
51
2
20
24
1.61
88847950--88848076
43
3.0
43
88
5
179
48
3
22
25
1.67
88851864--88851923
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
88858829--88858914
46
1.9
45
88
4
129
30
26
20
22
1.98
88859327--88859385
30
2.0
29
86
3
82
32
25
5
37
1.78
88882770--88882837
25
2.5
28
90
9
115
29
26
14
29
1.95
88888145--88888276
40
3.3
40
91
3
205
26
28
21
23
1.99
88888145--88888329
79
2.3
80
78
8
189
26
27
21
24
1.99
88890853--88890894
14
2.8
15
78
10
50
54
7
0
38
1.28
88894367--88894399
16
2.1
15
94
5
57
66
0
9
24
1.20
88895065--88895161
50
1.9
50
100
0
194
23
17
17
41
1.90
88902860--88903077
40
5.5
40
88
2
289
22
23
27
25
2.00
88908548--88908684
40
3.5
40
80
6
129
21
27
24
26
1.99
88908588--88908737
78
1.9
78
81
6
178
23
27
22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88912632--88912849
40
5.5
40
86
4
273
22
23
27
25
2.00
88918260--88918296
18
2.1
18
90
10
58
35
0
0
64
0.94
88918924--88918988
21
3.0
22
78
13
73
29
1
3
66
1.16
88920962--88921170
99
2.1
99
88
1
321
41
11
21
26
1.86
88923162--88923263
27
3.8
27
77
5
91
41
14
20
23
1.89
88926085--88926125
21
2.0
20
85
4
55
46
12
7
34
1.69
88927697--88927868
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
88927689--88927864
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
88930247--88930309
28
2.2
28
86
8
83
60
12
15
11
1.59
88930247--88930309
15
4.4
14
86
6
74
60
12
15
11
1.59
88933228--88933399
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
88933220--88933395
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
88936468--88936508
3
13.7
3
94
0
73
0
29
0
70
0.87
88936458--88936505
9
5.1
9
90
7
60
0
27
0
72
0.84
88937475--88937514
15
2.5
16
84
8
55
65
12
0
22
1.26
88943502--88943672
93
1.8
93
88
2
263
29
26
19
23
1.98
88943497--88943669
46
3.7
46
75
14
158
30
26
19
23
1.98
88944106--88944184
30
2.6
30
100
0
158
26
27
6
39
1.80
88944112--88944163
14
3.6
14
70
10
50
23
28
7
40
1.82
88944126--88944179
16
3.5
16
70
10
58
25
24
7
42
1.80
88947452--88947491
20
2.1
19
86
9
55
42
5
2
50
1.37
88947977--88948013
16
2.3
16
86
13
58
40
0
0
59
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88949723--88949823
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
88951930--88951973
14
3.0
15
90
3
63
52
0
18
29
1.46
88951978--88952013
3
12.0
3
100
0
72
66
0
0
33
0.92
88959350--88959514
5
31.8
5
87
10
171
78
1
0
18
0.87
88959360--88959519
44
3.7
43
87
9
213
78
1
0
18
0.88
88964818--88964842
13
1.9
13
100
0
50
48
8
0
44
1.32
88986505--88986657
34
4.5
34
84
4
184
43
13
22
20
1.86
88986481--88986657
67
2.6
67
83
5
205
44
13
21
20
1.85
88987079--88987143
32
2.0
32
96
0
121
32
10
15
41
1.81
88992934--88993006
28
2.5
29
84
4
94
31
28
15
24
1.95
89000786--89000887
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
89006139--89006269
29
4.6
29
81
3
140
25
32
16
25
1.96
89013601--89013732
29
4.6
29
81
1
140
25
31
16
25
1.96
89017114--89017148
15
2.3
15
95
0
61
37
14
28
20
1.91
89024826--89025129
140
2.2
137
80
9
321
24
29
18
27
1.98
89024826--89025129
47
6.5
46
72
13
185
24
29
18
27
1.98
89025242--89025273
17
2.0
17
88
11
50
46
18
3
31
1.65
89026520--89026602
40
2.1
40
97
0
157
30
21
9
38
1.86
89027276--89027322
19
2.5
20
83
10
55
34
23
0
42
1.54
89028877--89028938
31
2.0
31
96
0
115
37
8
16
38
1.78
89032203--89032300
40
2.3
42
84
6
119
28
27
16
27
1.97
89033888--89034018
35
3.7
35
76
12
126
41
15
17
25
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89035409--89035478
35
2.0
35
97
0
131
41
20
15
22
1.90
89041101--89041426
47
7.1
47
88
4
423
35
10
28
25
1.90
89041268--89041342
22
3.3
22
64
29
57
30
13
30
25
1.94
89041400--89041582
46
4.0
46
93
0
294
34
8
31
24
1.86
89043789--89044119
48
6.9
48
86
1
403
26
29
16
27
1.97
89043789--89044116
96
3.4
96
88
0
449
25
29
17
27
1.97
89043790--89044119
144
2.3
144
88
2
464
26
29
16
27
1.97
89046359--89046504
31
4.7
31
95
0
249
30
25
15
28
1.96
89046528--89046619
42
2.2
42
98
0
175
33
21
14
30
1.93
89046767--89046836
25
2.8
26
86
4
99
22
22
28
25
1.99
89047634--89047699
27
2.5
28
80
14
77
28
22
18
30
1.97
89047647--89047710
27
2.4
27
81
5
76
25
25
14
35
1.93
89047764--89047870
27
3.9
28
81
12
114
31
6
17
43
1.75
89047826--89047949
27
4.6
25
81
7
104
27
8
21
41
1.83
89047850--89047991
54
2.6
54
79
9
148
28
12
22
36
1.91
89047847--89047989
27
5.3
26
72
14
103
28
12
22
36
1.91
89047981--89048072
27
3.4
27
86
5
132
39
7
25
28
1.83
89047971--89048097
54
2.4
53
79
11
141
35
9
24
30
1.87
89051177--89051204
14
2.0
14
100
0
56
14
14
7
64
1.48
89052332--89052374
16
2.7
16
74
0
50
62
4
2
30
1.28
89052849--89052898
23
2.2
22
85
3
64
56
0
0
44
0.99
89055185--89055218
18
1.9
18
88
5
52
41
0
17
41
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89058580--89058649
27
2.5
28
90
2
115
28
14
25
31
1.95
89058580--89058661
27
3.0
27
82
8
69
29
15
23
31
1.95
89064209--89064508
41
7.4
41
87
2
392
37
23
21
18
1.94
89064922--89064975
25
2.2
25
100
0
108
27
7
24
40
1.81
89065593--89065624
15
2.1
15
94
0
55
59
0
9
31
1.29
89065596--89065663
24
2.8
23
78
10
73
55
0
4
39
1.20
89069298--89069328
7
4.4
7
100
0
62
38
0
0
61
0.96
89070063--89071316
476
2.6
476
99
0
2483
36
11
11
41
1.76
89077115--89077162
21
2.3
21
96
0
87
22
16
58
2
1.49
89077455--89077699
43
5.7
43
84
5
284
25
20
21
31
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770