Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  550  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
171049378--171049430
28
1.9
27
88
3
79
24
26
20
28
1.99
171049355--171049499
61
2.3
60
83
8
168
26
26
20
26
1.99
171049520--171049574
20
2.8
20
83
2
67
34
23
16
25
1.95
171060463--171060571
27
4.0
26
77
8
110
15
22
23
37
1.93
171060463--171060571
54
2.0
54
83
3
139
15
22
23
37
1.93
171080963--171081042
22
3.6
22
84
3
106
10
31
31
27
1.89
171082631--171082814
40
4.6
39
86
7
221
26
26
20
27
1.99
171089951--171090101
40
3.8
39
79
8
135
23
27
23
25
2.00
171094967--171095020
26
2.0
27
96
3
101
33
22
18
25
1.97
171099381--171099408
4
7.0
4
100
0
56
25
0
0
75
0.81
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3
11.7
3
100
0
70
31
0
0
68
0.90
171101555--171101662
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
171108923--171109030
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
171114369--171114393
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
171115241--171115266
13
2.0
13
100
0
52
69
0
7
23
1.14
171125174--171125204
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
171128693--171128730
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
171130355--171130423
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
171136684--171136721
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
171142478--171142628
40
3.8
40
80
4
153
25
25
26
22
2.00
171142518--171142643
40
3.2
39
79
10
139
23
26
26
23
2.00
171147051--171147116
21
3.1
21
84
4
89
36
21
13
28
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
171147054--171147115
10
6.0
10
78
10
63
37
22
11
29
1.89
171147154--171147202
25
2.0
25
87
0
71
28
12
22
36
1.90
171156321--171156398
37
2.1
37
100
0
156
20
32
19
28
1.97
171156501--171156623
49
2.5
49
95
0
219
29
33
10
26
1.90
171170184--171170367
40
4.6
40
78
4
147
22
24
29
23
1.99
171178269--171178412
40
3.7
38
79
8
137
24
23
28
23
2.00
171178274--171178457
79
2.3
80
81
4
194
20
24
30
24
1.99
171182650--171182915
24
11.1
24
97
0
480
20
17
25
36
1.94
171190676--171190942
24
11.1
24
97
0
480
20
17
25
36
1.94
171193993--171194028
9
4.0
9
92
0
63
44
13
11
30
1.79
171194240--171194298
30
2.0
30
86
6
84
18
40
0
40
1.51
171194943--171194971
5
5.8
5
100
0
58
20
20
17
41
1.90
171194953--171195192
114
2.1
114
100
0
480
34
17
10
37
1.85
171197776--171197873
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Copy
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Size
Copy
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51
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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