Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  586  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
183182954--183182986
16
2.1
16
94
0
57
39
9
12
39
1.74
183183451--183183484
15
2.3
15
89
0
50
35
2
23
38
1.70
183184485--183184524
19
2.1
19
90
0
62
30
15
2
52
1.55
183186211--183186239
14
2.1
14
100
0
58
34
0
13
51
1.42
183186364--183186403
21
1.9
21
89
0
62
30
12
0
57
1.36
183186987--183187011
11
2.3
11
100
0
50
64
8
0
28
1.22
183187674--183187713
14
2.7
15
88
7
55
17
5
0
77
0.94
183192368--183192413
23
2.0
23
100
0
92
34
13
13
39
1.83
183192956--183192983
14
2.0
14
100
0
56
35
7
21
35
1.81
183194141--183194198
29
2.0
29
100
0
116
37
17
13
31
1.89
183203651--183203699
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
183204521--183204687
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
183207593--183207773
40
4.6
40
90
3
287
27
26
22
23
1.99
183207593--183207773
79
2.3
80
92
3
296
27
26
22
23
1.99
183226063--183226222
29
5.5
29
76
5
171
29
29
16
24
1.97
183226063--183226281
58
3.8
58
93
2
361
29
30
15
24
1.96
183226092--183226281
29
6.6
29
76
6
179
30
30
15
24
1.95
183234229--183234386
28
5.6
28
77
6
131
29
29
16
24
1.96
183234229--183234360
58
2.3
56
96
2
237
30
28
16
24
1.97
183234229--183234386
29
5.6
28
79
6
149
29
29
16
24
1.96
183234229--183234375
56
2.6
56
90
7
224
29
29
16
24
1.96
183245502--183245549
25
1.9
25
83
8
62
56
20
4
18
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
183248405--183248505
31
3.3
31
67
20
93
32
16
8
41
1.80
183248404--183248526
62
2.0
63
96
1
230
33
16
8
42
1.77
183248405--183248505
30
3.3
31
67
15
91
32
16
8
41
1.80
183251183--183251234
27
1.9
27
84
0
68
34
15
17
32
1.91
183261840--183262086
40
6.2
40
91
4
351
24
23
27
25
2.00
183270774--183270956
39
4.6
39
80
8
192
25
21
27
25
1.99
183275505--183275577
28
2.6
29
89
6
105
26
16
31
26
1.96
183283271--183283344
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
183287292--183287469
40
4.5
40
89
3
236
24
27
23
24
2.00
183298820--183298972
39
3.9
39
92
0
252
23
20
32
23
1.98
183298821--183299002
39
4.6
39
89
0
247
23
21
31
23
1.98
183308418--183308568
40
3.8
40
77
6
146
27
23
26
22
1.99
183308455--183308584
40
3.2
40
77
4
138
24
23
27
23
2.00
183314759--183314907
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1.9
80
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2
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22
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24
22
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183314800--183314907
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2.7
38
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8
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29
25
23
1.99
183322877--183323025
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22
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24
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1.99
183322918--183323025
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
183327495--183327546
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2.1
25
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40
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25
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21
25
1.99
183327722--183328151
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3.6
119
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183327872--183327944
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183327722--183328128
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2.6
159
89
1
629
25
27
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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183330782--183330890
48
2.3
48
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23
17
24
1.96
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1.96
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183332118--183332242
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80
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26
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22
23
1.99
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22
5.3
22
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9
150
37
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20
25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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66
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20
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32
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2.5
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9
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21
27
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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2
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24
17
23
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.96
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4.2
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6
169
25
21
27
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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