Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  395  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121362881--121363005
30
4.0
29
70
23
83
30
17
22
29
1.97
121362879--121363027
66
2.3
66
81
9
169
31
17
22
28
1.96
121364209--121364241
3
11.0
3
100
0
66
33
0
0
66
0.92
121364857--121364882
3
8.7
3
100
0
52
34
34
0
30
1.58
121367185--121367266
8
9.6
8
73
19
51
62
0
2
35
1.09
121367128--121367246
44
2.6
43
81
15
116
61
0
4
33
1.21
121367192--121367310
38
3.3
35
74
12
89
60
3
2
33
1.27
121367310--121367358
22
2.2
23
88
3
73
63
2
0
34
1.06
121367333--121367406
10
7.5
10
67
24
50
64
2
2
29
1.21
121367330--121367377
21
2.3
20
79
10
53
66
4
2
27
1.21
121367334--121367406
30
2.5
31
82
6
89
64
2
2
30
1.21
121367334--121367417
29
2.8
29
78
10
89
64
2
3
29
1.23
121367328--121367417
20
4.5
20
70
19
71
64
2
3
30
1.22
121376179--121376209
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
121378986--121379010
11
2.3
11
100
0
50
0
8
16
76
1.02
121381362--121381536
30
5.8
30
87
1
219
26
48
4
21
1.69
121382096--121382237
25
5.6
25
71
12
74
31
7
3
57
1.42
121382386--121382433
16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
121382386--121382437
8
6.5
8
82
8
61
30
1
1
65
1.14
121394426--121394564
71
1.9
71
85
1
188
32
17
21
28
1.96
121394730--121394762
14
2.4
14
94
0
57
12
18
6
63
1.48
121394330--121394985
162
4.0
163
84
9
814
26
19
19
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121394892--121394926
14
2.5
14
95
0
61
17
17
5
60
1.55
121396345--121396511
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
121406027--121406197
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
121408950--121409010
25
2.3
26
81
13
72
34
26
13
26
1.93
121410393--121410548
68
2.2
68
78
13
158
20
27
16
35
1.94
121411816--121411890
28
2.7
27
85
2
96
24
25
18
32
1.97
121411828--121411929
27
3.8
26
80
13
91
23
23
18
34
1.96
121413214--121413274
30
2.0
30
83
0
77
36
13
19
31
1.90
121413877--121414005
47
2.7
47
97
0
240
34
13
24
26
1.93
121413978--121414137
54
3.0
53
82
0
185
36
15
23
24
1.93
121432531--121432713
40
4.7
40
85
7
250
24
22
27
25
2.00
121432531--121432711
78
2.3
79
86
5
251
24
22
27
25
2.00
121434404--121434445
22
2.0
22
95
4
77
9
40
28
21
1.84
121446287--121446360
29
2.6
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Copy
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Period
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Copy
Number
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25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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