Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  150  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44120797--44120845
26
1.9
25
83
4
62
36
4
0
59
1.17
44124392--44124417
13
2.0
13
100
0
52
7
23
30
38
1.83
44126605--44126657
8
6.8
8
76
10
56
84
0
13
1
0.69
44126603--44126657
22
2.6
21
83
8
67
85
0
12
1
0.68
44127623--44127707
43
2.0
43
88
4
127
30
16
25
27
1.97
44127702--44128285
119
5.0
119
93
4
999
32
18
19
29
1.95
44128016--44128231
109
2.0
110
95
0
389
31
18
18
31
1.95
44128209--44128559
83
4.2
83
95
1
616
31
20
20
27
1.97
44128927--44129072
35
4.2
34
90
7
215
38
11
11
38
1.78
44128922--44129081
68
2.3
69
87
7
234
39
10
12
37
1.78
44129549--44129614
19
3.6
18
75
15
55
37
1
0
60
1.06
44129550--44129614
17
3.9
17
73
15
55
36
1
0
61
1.05
44131640--44131726
16
5.1
17
70
21
58
35
2
3
58
1.27
44131597--44131699
54
1.9
54
80
7
120
33
1
2
62
1.21
44131925--44131963
20
2.0
20
85
10
53
35
0
2
61
1.10
44144692--44144724
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
44145661--44145738
31
2.5
31
89
2
122
26
24
16
32
1.96
44145958--44146027
25
2.8
25
93
0
113
24
22
25
27
2.00
44146836--44146923
27
3.3
27
75
9
81
21
19
19
39
1.92
44146954--44147060
27
3.9
27
72
13
83
32
7
18
41
1.79
44147041--44147113
27
2.7
27
89
0
110
27
10
23
38
1.88
44147038--44147153
27
4.3
26
74
10
99
28
13
22
35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44147145--44147209
27
2.4
27
78
0
85
44
9
21
24
1.81
44159049--44159100
22
2.4
22
87
6
70
25
15
28
30
1.96
44169763--44169831
34
2.0
34
97
0
129
14
24
20
40
1.90
44172174--44172399
33
6.9
32
81
5
231
36
20
11
31
1.88
44179881--44179933
4
12.5
4
82
13
54
73
0
3
22
0.99
44180492--44180546
28
2.0
27
82
10
67
38
0
3
58
1.16
44181447--44181488
20
2.2
20
86
4
59
40
0
4
54
1.21
44181798--44181838
18
2.2
18
86
8
55
36
2
2
58
1.24
44184516--44184549
13
2.8
12
86
8
50
44
0
2
52
1.16
44184513--44184558
20
2.2
22
88
7
69
41
0
4
54
1.20
44186393--44186429
2
18.5
2
88
0
56
48
45
2
2
1.30
44191955--44192094
27
5.2
28
90
5
184
35
22
24
17
1.96
44193711--44193820
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
44197879--44197915
14
2.7
14
88
12
51
81
2
0
16
0.81
44199243--44199294
15
3.7
15
78
19
58
38
0
0
61
0.96
44199241--44199361
10
12.6
10
73
19
91
36
4
0
58
1.23
44199243--44199361
36
3.3
36
76
10
127
36
4
0
58
1.23
44199325--44199370
21
2.2
21
85
14
60
30
6
4
58
1.43
44211371--44211912
44
12.3
44
87
0
715
30
13
26
29
1.94
44213473--44213561
28
3.0
28
72
18
74
35
6
0
57
1.25
44213473--44213577
12
8.8
12
69
24
62
34
5
0
59
1.28
44214917--44215084
40
4.2
40
81
1
176
25
26
22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44223949--44224007
24
2.4
23
80
8
64
45
3
5
45
1.42
44224015--44224048
5
6.8
5
100
0
68
41
0
0
58
0.98
44224123--44224151
14
2.1
14
100
0
58
75
0
24
0
0.80
44225242--44225291
20
2.5
21
75
12
52
22
10
2
66
1.32
44230508--44230590
41
2.0
41
92
0
139
32
12
22
32
1.91
44233668--44233701
16
2.1
17
88
5
52
35
0
23
41
1.55
44237647--44237756
26
4.2
26
92
0
175
37
23
5
33
1.78
44238694--44238880
3
62.3
3
66
23
74
60
1
3
34
1.22
44238681--44238798
18
6.2
19
71
18
77
61
1
3
33
1.23
44238678--44238832
20
8.2
18
70
22
88
60
1
2
35
1.19
44238694--44238886
33
5.9
33
69
21
120
60
1
3
34
1.22
44238696--44238832
17
8.3
17
72
20
87
60
0
2
36
1.14
44251590--44251733
40
3.6
40
79
0
135
28
21
25
24
1.99
44262749--44262929
49
3.7
47
75
13
150
25
20
25
28
1.99
44262806--44262939
50
2.7
50
83
1
169
26
20
24
28
1.99
44262750--44262938
101
1.9
100
86
3
272
25
21
24
28
1.99
44268158--44268389
49
4.7
50
84
2
279
26
18
26
28
1.98
44271878--44271951
23
3.3
22
73
5
76
18
18
18
43
1.89
44271857--44271978
46
2.7
46
89
1
174
19
16
20
43
1.88
44273244--44273317
24
3.1
24
82
0
94
32
28
13
25
1.94
44276893--44276956
29
2.2
29
91
5
103
26
32
21
18
1.97
44278554--44278741
50
3.8
50
80
4
204
25
25
21
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44280777--44280857
29
2.8
29
82
0
108
25
24
25
23
2.00
44287509--44287541
14
2.4
14
95
5
59
24
15
18
42
1.88
44288777--44288824
25
1.9
25
91
8
80
54
20
4
20
1.61
44291159--44291261
29
3.6
28
81
5
116
21
16
33
29
1.95
44294304--44294363
25
2.3
25
85
5
75
16
23
11
48
1.79
44296031--44296082
4
13.5
4
80
8
54
28
1
0
69
0.99
44296031--44296083
27
2.0
27
85
7
72
30
1
0
67
1.01
44296043--44296094
16
3.3
15
80
20
54
30
3
0
65
1.10
44296694--44296721
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
44296721--44296745
2
12.5
2
100
0
50
0
0
48
52
1.00
44296838--44297018
12
15.5
12
65
15
67
26
5
7
60
1.46
44302394--44302454
32
1.9
31
86
3
86
44
11
13
31
1.79
44306431--44306478
23
2.0
23
84
4
60
43
14
12
29
1.82
44306473--44306595
61
2.0
61
95
0
219
25
21
7
46
1.77
44308601--44308699
43
2.3
43
77
6
103
27
24
22
26
2.00
44310985--44311213
48
4.8
48
69
8
162
27
18
26
27
1.98
44313455--44313582
37
3.4
37
96
1
229
25
32
17
23
1.97
44313622--44313725
48
2.2
48
94
3
183
30
28
5
34
1.81
44313717--44314003
49
5.9
49
95
1
497
29
27
9
33
1.88
44313717--44314005
96
3.0
96
94
2
506
29
28
8
33
1.88
44320307--44320523
46
4.6
45
77
11
195
24
29
17
28
1.97
44320996--44321036
21
2.0
21
85
0
55
29
24
4
41
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44326793--44326906
55
2.1
55
96
0
210
34
20
11
34
1.88
44327464--44327626
46
3.5
46
82
7
163
25
30
15
28
1.96
44331524--44331562
16
2.4
16
100
0
78
28
23
12
35
1.91
44340371--44340403
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
44345611--44345671
30
2.0
30
83
0
77
39
6
24
29
1.80
44353492--44353714
48
4.7
49
73
14
180
26
19
27
26
1.99
44355528--44355657
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00
44355528--44355691
40
4.1
40
78
4
145
21
28
25
25
1.99
44359569--44359957
191
2.0
191
98
0
762
40
4
20
34
1.73
44366522--44367093
48
11.8
48
79
4
459
27
25
16
30
1.96
44366523--44366743
98
2.3
98
83
1
264
27
28
16
28
1.97
44380020--44380120
38
2.6
38
88
3
139
22
26
25
24
2.00
44380036--44380136
38
2.7
38
88
0
139
20
24
25
28
1.99
44380138--44380247
43
2.6
43
98
0
211
10
27
33
29
1.89
44383427--44383673
40
6.2
40
93
3
394
23
23
27
25
2.00
44391639--44391920
40
7.1
40
93
3
457
24
22
26
26
2.00
44394312--44394373
32
1.9
32
93
0
106
30
11
14
43
1.80
44398549--44398600
24
2.5
20
76
17
52
55
1
1
40
1.22
44405209--44405294
31
2.8
31
91
1
138
25
27
16
30
1.97
44405512--44405579
26
2.6
26
85
0
91
33
26
22
17
1.96
44405630--44405677
11
4.6
11
80
12
57
33
18
12
35
1.89
44410830--44410960
46
2.8
47
86
3
167
22
20
22
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44424400--44424494
44
2.2
44
98
1
183
24
34
28
12
1.92
44426620--44426751
29
4.6
29
80
5
115
23
33
15
27
1.95
44434695--44434826
29
4.6
29
80
5
115
23
33
15
27
1.95
44442530--44442641
18
6.2
18
75
0
107
34
15
14
35
1.87
44442530--44442641
36
3.1
36
82
0
134
34
15
14
35
1.87
44444112--44444337
49
4.6
50
79
9
248
25
17
26
30
1.97
44444111--44444335
100
2.3
97
83
6
265
25
17
26
30
1.97
44446727--44446761
13
2.8
12
87
8
52
0
25
0
74
0.82
44446726--44446809
12
6.8
11
71
20
51
3
22
3
70
1.19
44447230--44447273
15
2.8
17
77
19
51
56
6
0
36
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770