Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  207  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62006972--62007068
33
2.9
34
80
10
101
25
27
20
25
1.99
62008243--62008287
22
2.0
22
100
0
90
26
31
0
42
1.56
62018669--62018755
44
2.0
44
88
0
129
29
12
20
36
1.90
62018936--62018968
9
3.7
9
95
0
57
57
0
12
30
1.35
62022987--62023161
46
3.8
45
75
15
169
21
21
28
29
1.99
62022984--62023154
93
1.8
93
88
2
263
21
21
28
28
1.99
62026912--62027083
46
3.7
46
96
0
308
21
20
27
30
1.98
62033384--62033509
46
2.7
46
93
0
216
22
19
26
31
1.98
62037603--62038130
48
11.0
48
94
0
876
35
6
26
32
1.81
62038175--62038282
37
2.9
37
94
0
189
24
19
32
24
1.98
62041726--62041767
21
2.0
22
90
4
68
35
23
0
40
1.55
62046127--62046172
23
2.0
24
95
4
85
60
8
8
21
1.53
62049297--62049527
40
5.8
40
91
3
333
23
24
28
22
1.99
62051720--62051858
40
3.5
40
90
2
201
23
20
29
25
1.99
62051719--62051884
79
2.1
79
80
6
185
24
20
28
27
1.99
62060626--62060815
40
4.8
40
85
3
233
23
23
28
24
2.00
62068115--62068217
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
62078896--62078932
19
1.9
19
94
0
65
35
10
13
40
1.80
62080813--62080873
30
2.0
30
100
0
122
29
21
26
22
1.99
62081192--62081229
19
2.0
20
84
5
51
36
15
26
21
1.93
62088643--62088834
39
4.9
39
84
5
239
28
16
24
30
1.97
62088648--62088863
78
2.8
78
88
5
287
29
17
24
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62096334--62096548
39
5.5
39
87
2
281
27
16
25
31
1.96
62096334--62096548
79
2.8
78
88
2
281
27
16
25
31
1.96
62100016--62100178
81
2.0
81
91
4
267
37
21
14
26
1.92
62104389--62104629
40
6.1
40
87
4
303
22
21
29
27
1.99
62112557--62112759
40
5.1
40
88
5
281
21
22
29
26
1.99
62112557--62112759
79
2.5
80
87
7
281
21
22
29
26
1.99
62115257--62115408
39
3.9
39
93
0
250
22
31
22
23
1.98
62121239--62121370
29
4.5
29
97
1
237
24
23
14
37
1.92
62121239--62121370
59
2.3
59
95
1
239
24
23
14
37
1.92
62122710--62122745
18
1.9
18
88
5
54
11
25
0
63
1.27
62128928--62129042
29
4.0
29
89
4
108
26
22
14
36
1.93
62128940--62129042
29
3.5
29
96
2
188
24
24
14
36
1.93
62128939--62129072
59
2.2
60
89
1
207
25
25
14
35
1.93
62130384--62130419
18
1.9
18
88
5
54
11
25
0
63
1.27
62134202--62134383
39
4.6
39
90
0
247
21
31
23
23
1.98
62134232--62134383
39
3.9
39
93
0
250
22
31
22
23
1.98
62142511--62142537
8
3.4
8
100
0
54
0
48
14
37
1.45
62148064--62148245
39
4.6
39
90
0
247
23
31
21
23
1.98
62148094--62148245
39
3.9
39
94
0
250
23
31
21
23
1.98
62156049--62156160
37
2.9
38
86
6
154
24
33
19
23
1.97
62157952--62158004
27
2.0
27
85
3
72
28
11
20
39
1.87
62164992--62165083
27
3.4
27
82
5
105
28
25
7
39
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62165114--62165315
27
7.4
27
75
6
149
41
18
8
31
1.80
62165114--62165315
54
3.7
54
74
7
192
41
18
8
31
1.80
62165341--62165414
27
2.7
27
76
12
71
37
20
20
21
1.94
62165354--62165418
27
2.4
27
82
5
78
35
18
24
21
1.96
62166223--62166306
25
3.4
24
72
15
64
30
20
19
29
1.97
62166242--62166300
25
2.4
25
80
8
68
30
16
16
35
1.92
62166441--62166529
42
2.1
42
93
0
151
29
11
19
40
1.86
62166556--62166634
31
2.5
31
95
0
140
26
17
26
29
1.98
62168253--62168312
28
2.1
28
81
0
66
25
25
25
25
2.00
62169748--62169807
28
2.1
28
93
0
102
48
13
26
11
1.76
62172989--62173049
5
11.8
5
74
6
50
36
9
19
34
1.85
62172991--62173049
10
5.7
10
76
11
57
35
10
20
33
1.86
62172991--62173065
21
3.6
20
80
5
78
34
12
18
34
1.88
62173097--62173168
25
3.0
24
80
13
76
29
22
22
26
1.99
62180638--62180757
49
2.5
49
97
1
224
30
9
29
30
1.88
62180752--62180909
48
3.3
48
91
0
264
35
6
25
31
1.83
62180687--62180910
96
2.3
94
82
7
247
33
7
26
32
1.85
62180949--62181076
37
3.4
37
94
1
220
22
17
33
25
1.96
62182951--62183302
40
8.8
40
90
0
515
28
21
26
24
1.99
62187131--62187251
49
2.5
49
98
0
233
31
9
28
30
1.88
62187227--62187404
48
3.7
48
90
1
275
34
7
26
32
1.84
62187444--62187569
37
3.4
37
94
1
216
22
17
34
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62191761--62191787
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
62195540--62195588
25
2.0
25
87
0
71
36
22
14
26
1.92
62195625--62195664
21
1.9
21
89
0
62
40
7
17
35
1.78
62195625--62195676
21
2.5
21
83
0
59
38
9
15
36
1.80
62195738--62195783
24
1.9
24
86
8
67
26
21
28
23
1.99
62200362--62200548
56
3.4
56
88
1
286
31
23
17
27
1.97
62201402--62201519
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
62201370--62201533
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
62208019--62208136
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
62207987--62208150
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
62214008--62214045
2
19.5
2
94
5
69
50
0
0
50
1.00
62217346--62217498
39
3.9
39
90
0
225
24
20
30
24
1.99
62217347--62217529
78
2.3
79
86
1
242
24
22
29
24
1.99
62217346--62217534
39
4.8
39
86
1
209
23
21
30
24
1.99
62219224--62219434
56
3.8
56
92
0
350
31
22
16
28
1.96
62221154--62221323
46
3.6
44
76
12
128
27
20
32
20
1.97
62227826--62228210
39
9.9
39
89
0
583
27
28
23
19
1.98
62227795--62228212
196
2.1
194
91
1
667
28
28
23
20
1.99
62234482--62234731
40
6.2
40
91
1
385
22
28
24
25
1.99
62244943--62245071
44
2.9
45
79
15
169
21
20
29
28
1.98
62247992--62248060
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
62247983--62248070
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62250446--62250579
46
2.9
48
80
12
179
20
20
29
28
1.98
62253721--62253869
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
62253762--62253869
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
62257279--62257502
40
5.6
40
87
3
299
27
27
21
23
1.99
62257279--62257503
81
2.8
80
87
4
319
27
27
21
23
1.99
62258899--62258941
14
3.1
14
80
6
52
58
9
2
30
1.42
62258899--62258937
13
2.9
13
84
3
51
58
10
2
28
1.44
62259282--62259332
26
2.0
26
100
0
102
43
9
11
35
1.75
62264036--62264060
13
1.9
13
100
0
50
0
44
0
56
0.99
62268682--62268706
13
1.9
13
100
0
50
36
24
8
32
1.84
62276836--62276905
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
62285473--62285571
27
3.7
27
78
6
112
41
20
8
30
1.81
62285578--62285747
27
6.3
27
82
0
169
36
22
5
35
1.77
62285574--62285691
54
2.2
54
92
0
191
33
22
5
38
1.78
62285597--62285754
54
2.9
54
84
0
190
37
21
5
34
1.77
62285737--62285987
27
9.3
27
84
3
236
37
19
16
25
1.93
62285711--62285812
27
3.7
27
83
5
107
44
23
5
26
1.76
62285795--62285987
54
3.6
54
87
1
262
36
19
19
24
1.95
62285768--62285987
81
2.7
81
85
2
273
36
20
18
25
1.94
62286393--62286485
6
15.3
6
70
18
68
19
17
15
48
1.81
62286393--62286467
30
2.5
30
86
2
96
20
17
14
48
1.82
62296076--62296145
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62302770--62302867
28
3.5
28
84
4
108
29
16
23
30
1.96
62316084--62316247
40
4.1
40
79
6
179
24
21
28
25
1.99
62319046--62319307
46
5.5
46
78
8
222
28
18
28
24
1.98
62319046--62319309
94
2.8
94
81
6
309
28
18
28
24
1.98
62325099--62325362
94
2.8
94
83
8
329
28
20
28
23
1.99
62325096--62325360
46
5.6
46
76
8
219
28
20
28
23
1.99
62325767--62325859
19
4.9
19
96
2
170
36
9
16
37
1.81
62325767--62325866
37
2.7
38
92
6
170
37
9
17
37
1.81
62325767--62325882
19
5.8
22
91
6
87
36
8
16
38
1.79
62325848--62325892
23
2.0
23
86
4
65
33
4
15
46
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770