Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  478  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
147673628--147674115
206
2.4
206
89
2
729
29
22
17
30
1.97
147673812--147674374
305
1.8
305
94
1
995
29
21
17
31
1.96
147674421--147674584
44
3.7
43
74
9
152
26
24
17
31
1.97
147675430--147675500
14
4.9
14
79
16
72
5
12
0
81
0.85
147675426--147675476
24
2.1
24
85
7
68
7
15
0
76
1.00
147675438--147675495
16
3.8
16
75
13
59
3
13
0
82
0.79
147675432--147675474
8
5.4
8
80
0
50
6
9
0
83
0.80
147675432--147675488
24
2.4
25
86
11
77
5
10
0
84
0.77
147675462--147675499
10
3.7
10
86
6
58
0
13
0
86
0.56
147675432--147675500
15
4.5
15
73
8
59
4
11
0
84
0.77
147680326--147680391
19
3.2
21
87
6
64
36
19
9
34
1.84
147680343--147680440
19
5.2
19
90
7
155
36
16
10
36
1.82
147680343--147680440
36
2.6
37
88
9
144
36
16
10
36
1.82
147681027--147681082
11
4.9
11
73
16
51
60
0
0
39
0.97
147681806--147681840
16
2.2
16
100
0
70
51
0
0
48
1.00
147681802--147681839
16
2.2
18
81
18
62
52
0
0
47
1.00
147683380--147683415
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
147683367--147683407
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
147684048--147684094
15
3.1
15
81
0
67
48
12
2
36
1.53
147685004--147685047
23
1.9
23
85
0
61
6
18
4
70
1.27
147685054--147685083
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
147686887--147686926
20
2.0
20
85
5
53
82
2
10
5
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
147700576--147700709
71
1.9
71
90
0
214
30
16
23
29
1.96
147700485--147701011
160
3.4
160
94
4
915
29
16
21
32
1.95
147700736--147701057
71
4.5
71
82
10
381
31
16
21
30
1.95
147706163--147706263
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
147714124--147714224
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
147718132--147718302
93
1.8
93
86
2
245
30
26
20
22
1.98
147718124--147718295
46
3.7
45
73
10
159
31
27
19
22
1.97
147721046--147721263
40
5.5
40
90
2
316
25
28
22
23
1.99
147723722--147723824
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
147733506--147733553
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
147733597--147733655
20
3.0
20
92
0
100
37
11
20
30
1.89
147733706--147733800
24
4.0
24
85
10
124
28
21
24
26
1.99
147733707--147733800
47
2.0
49
85
12
133
27
21
24
26
1.99
147733992--147734154
38
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Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
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Score
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Period
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28
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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