Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  12  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3172122--3172154
17
1.9
17
100
0
66
30
24
6
39
1.79
3175065--3175093
14
2.0
15
93
6
51
41
0
0
58
0.98
3175682--3175730
24
2.1
23
84
3
62
42
8
10
38
1.68
3176289--3176334
23
1.9
25
86
8
69
32
2
6
58
1.36
3176317--3176346
14
2.2
14
94
5
53
33
0
3
63
1.11
3176323--3176382
28
2.1
30
81
6
70
46
1
3
48
1.28
3179562--3179613
24
2.1
25
89
3
79
53
1
1
42
1.23
3179679--3179703
12
2.1
12
100
0
50
32
0
0
68
0.90
3183279--3183317
19
2.1
19
85
0
51
2
10
5
82
0.93
3183803--3183850
12
4.1
11
81
7
51
52
6
35
6
1.52
3184321--3184354
3
11.3
3
87
0
50
29
35
2
32
1.73
3184727--3184759
8
4.2
8
84
7
50
39
0
9
51
1.34
3185431--3185466
19
1.9
19
88
5
56
52
2
2
41
1.30
3186073--3186140
24
2.8
24
69
13
57
47
1
2
48
1.26
3186254--3186297
12
3.6
12
75
6
52
59
0
4
36
1.18
3186253--3186302
15
3.7
15
70
25
56
56
0
4
40
1.18
3187934--3187981
22
2.2
22
100
0
96
41
0
22
35
1.54
3189005--3189044
20
2.0
20
85
0
53
72
7
0
20
1.08
3189062--3189129
9
7.6
9
80
6
84
29
7
17
45
1.75
3189062--3189130
27
2.5
28
86
11
99
28
7
17
46
1.75
3199685--3199736
24
2.1
25
96
3
97
51
13
23
11
1.73
3202620--3202967
174
2.0
175
84
2
459
41
21
14
22
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3208565--3208656
46
2.0
46
95
0
166
25
29
18
27
1.98
3221024--3221067
20
2.2
20
87
0
61
54
9
2
34
1.44
3222601--3222625
13
1.9
13
100
0
50
84
0
16
0
0.63
3222771--3222817
17
2.6
18
83
6
60
0
10
19
70
1.16
3224034--3224198
65
2.6
65
85
2
208
38
10
19
30
1.86
3224913--3224941
10
3.0
10
95
5
51
0
0
6
93
0.36
3224912--3224940
14
2.0
15
93
6
51
0
0
10
89
0.48
3232137--3232178
19
2.2
20
86
4
59
47
7
19
26
1.74
3235818--3235861
20
2.2
20
87
0
61
54
9
2
34
1.44
3237561--3237607
17
2.6
18
83
6
60
0
10
19
70
1.16
3239102--3239155
16
3.4
16
81
0
54
72
0
9
18
1.11
3245950--3246021
35
2.1
35
97
0
135
27
15
25
31
1.95
3246599--3246712
43
2.7
43
90
1
176
18
22
34
24
1.96
3251170--3251234
21
3.0
21
71
13
51
46
0
3
50
1.17
3251236--3251285
21
2.5
21
87
6
68
48
0
0
52
1.00
3251355--3251400
20
2.4
18
86
13
65
30
0
2
67
1.03
3251444--3251549
10
10.4
10
68
22
53
42
0
0
55
1.12
3251471--3251513
21
2.0
20
86
13
59
51
0
0
48
1.00
3254611--3254644
17
1.9
18
88
5
52
14
38
26
20
1.91
3257763--3257864
30
3.4
30
91
0
150
30
19
23
26
1.98
3260537--3260583
20
2.2
20
85
7
58
48
6
2
42
1.40
3260610--3260648
20
2.0
20
89
0
60
41
2
0
56
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3273115--3273184
21
3.5
20
92
5
106
41
0
0
58
0.98
3273348--3273395
24
2.0
24
83
4
60
52
2
0
45
1.12
3280689--3280725
18
2.0
19
89
5
58
56
0
2
40
1.13
3280784--3280851
9
7.2
9
73
25
52
76
2
2
17
1.04
3280817--3280864
25
2.0
25
87
4
71
75
4
2
18
1.07
3280784--3280868
17
4.8
17
72
17
59
75
3
3
17
1.09
3280830--3280877
17
2.8
17
83
3
60
72
4
4
18
1.17
3281502--3281553
21
2.5
22
84
9
63
76
9
9
3
1.12
3281504--3281553
20
2.5
20
90
3
73
78
10
8
4
1.09
3281519--3281562
20
2.2
20
84
8
54
81
6
6
4
0.97
3281687--3281755
3
23.7
3
72
11
54
66
1
31
0
1.00
3281686--3281756
23
3.1
23
81
6
90
67
1
30
0
0.99
3282316--3283871
150
10.4
150
89
3
2259
57
6
7
28
1.51
3282465--3282525
13
4.5
13
76
13
61
68
3
1
26
1.14
3282316--3283871
299
5.2
298
92
3
2305
57
6
7
28
1.51
3282316--3283871
451
3.5
448
90
3
2336
57
6
7
28
1.51
3286416--3286454
17
2.3
17
91
8
62
46
10
10
33
1.72
3291203--3291261
26
2.4
23
82
15
82
40
10
10
38
1.73
3291211--3291268
26
2.2
26
96
0
107
39
6
10
43
1.66
3291369--3291431
25
2.4
26
79
10
67
0
36
0
63
0.95
3291358--3291434
20
4.2
18
79
12
77
0
33
0
66
0.92
3291563--3291608
18
2.5
19
92
7
85
8
13
8
69
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3294451--3294510
27
2.2
28
79
8
70
55
11
3
30
1.52
3301422--3301470
25
2.0
25
84
4
64
63
8
0
28
1.23
3301434--3301498
25
2.9
23
80
15
66
66
7
0
26
1.19
3301460--3301498
19
2.0
20
90
5
62
71
7
0
20
1.10
3302470--3302591
50
2.5
49
82
5
142
27
22
14
36
1.93
3304681--3304745
31
2.1
31
100
0
130
35
18
9
36
1.83
3305534--3305644
47
2.4
47
80
6
127
36
21
15
27
1.93
3317052--3317138
37
2.3
36
94
5
147
26
33
19
20
1.97
3317207--3317424
49
4.4
49
94
1
355
31
28
7
31
1.86
3317207--3317627
98
4.1
98
72
20
356
31
29
7
31
1.86
3317351--3317491
67
2.1
67
97
0
264
33
31
5
29
1.81
3317301--3317540
116
2.1
116
95
0
435
32
31
6
29
1.83
3317396--3317442
18
2.6
18
79
3
58
36
34
0
29
1.58
3317270--3317589
165
1.9
165
95
0
577
30
31
7
30
1.85
3317417--3317625
49
4.3
49
96
0
382
31
30
7
30
1.85
3320890--3321161
40
6.8
40
94
0
463
26
30
19
22
1.98
3329592--3329706
60
1.9
60
85
7
162
39
4
14
41
1.66
3330914--3330974
30
2.0
30
100
0
122
21
22
36
19
1.95
3331465--3331590
58
2.2
58
79
0
144
24
30
19
25
1.98
3331480--3331621
58
2.4
58
77
4
153
25
28
21
23
1.99
3334718--3334813
44
2.2
44
84
3
122
45
8
10
35
1.68
3335280--3335399
40
3.0
40
95
0
204
39
12
9
39
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3335598--3335644
13
3.5
13
73
21
51
63
0
4
31
1.13
3335958--3336002
2
22.5
2
95
0
81
53
0
0
46
1.00
3342913--3343136
46
4.8
46
77
9
240
21
21
27
29
1.99
3342959--3343129
93
1.8
93
91
2
281
21
21
28
29
1.98
3348749--3348884
26
5.2
26
97
0
245
34
5
23
36
1.79
3350502--3350641
27
5.2
27
88
2
183
17
24
22
35
1.96
3350502--3350641
54
2.6
55
89
2
203
17
24
22
35
1.96
3352530--3352586
30
1.9
30
82
13
73
47
3
0
49
1.18
3352761--3352811
13
3.9
13
81
0
66
43
9
0
47
1.36
3355305--3355389
24
3.6
25
76
10
72
48
3
7
41
1.47
3355878--3356027
39
3.9
39
91
0
203
29
20
4
46
1.71
3355878--3356027
77
1.9
78
84
1
203
29
20
4
46
1.71
3358381--3358435
28
2.0
28
100
0
110
40
7
10
41
1.68
3362378--3362425
14
3.5
13
81
10
51
31
0
0
68
0.90
3377526--3377566
22
1.9
22
90
5
66
73
7
12
7
1.25
3378778--3378802
6
4.2
6
100
0
50
52
0
0
48
1.00
3385403--3385444
21
1.9
23
85
9
61
26
4
4
64
1.33
3400812--3400862
19
2.5
21
75
12
54
64
3
1
29
1.22
3405111--3405150
11
3.6
11
82
0
53
22
15
5
57
1.57
3405269--3405301
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
3405760--3405809
21
2.4
21
89
0
82
14
24
18
44
1.86
3413483--3413512
15
2.0
15
93
0
51
26
3
3
66
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3417976--3418027
19
2.6
19
81
6
68
44
0
0
55
0.99
3421056--3421139
26
3.2
26
91
0
132
34
22
5
36
1.79
3424975--3425030
28
2.0
28
85
0
76
39
21
10
28
1.87
3429585--3430295
44
15.8
44
73
8
363
28
19
17
33
1.95
3429722--3430205
140
3.5
140
75
7
457
30
19
16
34
1.94
3429620--3430245
273
2.3
273
81
3
706
29
20
16
33
1.94
3429815--3430245
133
3.2
133
75
8
420
30
20
16
33
1.94
3429618--3430295
229
3.0
224
76
8
604
28
19
17
33
1.95
3441682--3441746
30
2.2
30
100
0
130
30
21
16
30
1.96
3442392--3442439
20
2.4
20
82
0
60
72
2
4
20
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770