Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  441  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
135722089--135722128
21
2.0
21
90
5
64
20
27
40
12
1.88
135733094--135733271
49
3.6
49
90
1
250
24
30
18
26
1.98
135733334--135733462
46
2.8
45
86
6
163
24
31
17
27
1.97
135736720--135736748
14
2.0
15
93
6
51
27
0
20
51
1.47
135737886--135737993
43
2.6
42
79
7
121
25
20
24
30
1.98
135742376--135742422
19
2.3
20
82
10
60
36
0
14
48
1.44
135744017--135744201
79
2.3
81
82
7
218
24
27
23
24
2.00
135744017--135744201
40
4.6
40
74
11
146
24
27
23
24
2.00
135745763--135745972
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
135759916--135759985
27
2.5
28
93
2
115
27
14
28
30
1.95
135759916--135759997
27
3.0
27
84
8
69
28
15
25
30
1.96
135762202--135762302
28
3.5
30
83
6
127
30
13
26
28
1.94
135762202--135762302
29
3.5
29
81
9
116
30
13
26
28
1.94
135769147--135769302
27
5.8
27
82
10
185
33
21
25
19
1.97
135769162--135769305
54
2.7
54
93
2
245
34
23
24
18
1.96
135784217--135784289
27
2.6
27
82
8
83
31
28
12
27
1.93
135788655--135788852
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
135788721--135788838
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
135788689--135788852
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
135796244--135796450
40
5.2
39
82
4
218
25
26
22
26
2.00
135797849--135797899
20
2.5
20
96
3
93
21
19
19
39
1.93
135802042--135802225
40
4.6
40
81
2
172
28
22
26
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
135802082--135802270
80
2.4
80
77
5
184
24
22
29
23
1.99
135810126--135810226
39
2.5
40
82
3
123
30
22
25
20
1.98
135810126--135810308
40
4.6
40
81
4
172
27
22
26
22
1.99
135813179--135813248
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
135822427--135822486
27
2.2
27
85
5
77
25
15
26
33
1.95
135822570--135822612
17
2.5
17
100
0
86
11
41
34
11
1.78
135824863--135824895
4
8.2
4
100
0
66
51
0
0
48
1.00
135824968--135825032
28
2.3
28
83
0
94
27
32
13
26
1.94
135828987--135829045
30
2.0
30
83
6
75
42
8
18
30
1.80
135829311--135829402
40
2.3
40
87
7
125
27
14
27
31
1.95
135829813--135829864
26
2.0
26
100
0
104
23
26
26
23
2.00
135831495--135831585
43
2.1
43
97
0
173
50
18
6
24
1.70
135833761--135833790
14
2.1
15
93
6
53
13
10
13
63
1.52
135838169--135838210
15
2.8
16
75
10
52
26
23
7
42
1.80
135847365--135847424
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
135847421--135847448
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
135847482--135847532
27
1.9
26
84
4
66
35
19
27
17
1.94
135849573--135851029
727
2.0
727
97
0
2725
29
27
16
27
1.97
135855609--135855677
28
2.5
28
88
6
97
27
14
27
30
1.95
135855609--135855687
28
2.9
27
85
9
81
27
15
25
31
1.95
135858556--135858595
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
135872746--135872875
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
135872746--135872913
40
4.2
40
79
4
153
23
27
23
25
2.00
135877484--135877667
79
2.3
81
84
8
236
26
27
21
24
1.99
135877465--135877667
39
5.1
40
81
9
238
26
27
21
25
2.00
135879224--135879353
40
3.2
40
84
4
174
23
29
24
22
1.99
135881633--135881668
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
135893879--135893926
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
135893970--135894028
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
135893974--135894028
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
135894079--135894197
24
5.0
24
88
5
170
28
21
22
26
1.99
135894079--135894197
47
2.5
48
89
5
170
28
21
22
26
1.99
135894389--135894484
31
3.1
31
95
0
174
40
15
21
21
1.91
135901949--135902015
31
2.1
32
86
8
91
35
5
34
23
1.80
135904097--135904127
15
2.0
16
93
6
55
61
0
0
38
0.96
135904270--135904328
30
2.0
30
86
0
82
49
10
8
32
1.67
135906521--135906550
12
2.6
11
90
10
51
33
26
0
40
1.57
135920825--135921007
40
4.6
40
87
6
223
26
21
26
25
1.99
135920857--135921039
79
2.3
78
80
10
194
28
20
25
25
1.99
135929267--135929435
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
135937187--135937355
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
135943330--135943382
27
2.0
26
81
3
61
73
0
11
15
1.09
135947973--135948010
15
2.4
17
82
8
53
57
7
2
31
1.41
135952935--135952961
7
3.9
7
100
0
54
44
11
29
14
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
135953944--135954015
34
2.1
34
100
0
144
47
11
19
22
1.80
135957181--135957338
68
2.3
68
78
11
169
20
29
15
34
1.94
135964661--135964817
68
2.3
68
78
11
167
21
29
15
33
1.94
135967012--135967086
36
2.1
36
95
5
134
28
21
9
41
1.84
135970135--135970181
25
1.9
24
86
4
67
40
0
2
57
1.11
135970139--135970188
25
2.0
25
84
0
64
42
2
2
54
1.23
135970794--135970831
17
2.1
19
85
9
53
39
2
0
57
1.12
135972078--135972117
20
2.0
20
86
13
57
47
7
0
45
1.31
135979118--135979302
79
2.3
82
83
7
229
24
24
27
23
2.00
135979119--135979310
40
4.8
40
79
7
151
24
24
28
22
2.00
135979118--135979335
79
2.7
79
79
6
183
24
23
27
24
2.00
135987872--135988054
39
4.6
39
87
0
240
22
30
22
24
1.99
135996185--135996345
29
5.6
29
84
1
171
24
16
32
25
1.96
135996377--135996409
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
135998494--135998645
39
3.9
39
90
0
223
23
31
20
24
1.98
136001017--136002978
541
3.6
541
94
0
3381
37
17
12
33
1.87
136003316--136003425
26
4.2
26
94
2
177
34
4
24
36
1.76
136005046--136005205
27
6.0
25
80
10
142
21
23
21
33
1.97
136005043--136005187
54
2.7
54
90
3
220
20
22
23
33
1.97
136007323--136007535
24
9.0
24
89
4
317
28
21
22
28
1.99
136007323--136007537
71
3.0
71
92
3
335
28
20
22
28
1.99
136007323--136007535
47
4.5
48
92
3
317
28
21
22
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
136007593--136007649
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
136007581--136007651
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
136007586--136007640
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
136012614--136012680
26
2.5
28
88
9
104
43
26
10
19
1.83
136017988--136018096
26
4.2
26
95
1
184
33
4
24
36
1.76
136019493--136019568
26
2.8
26
88
4
98
34
21
13
31
1.91
136019672--136019803
27
4.9
25
81
10
147
19
24
21
34
1.97
136019669--136019807
54
2.6
54
90
3
210
20
23
21
34
1.97
136020743--136022953
541
4.1
541
94
0
3895
36
18
11
33
1.86
136022981--136023010
10
3.1
10
95
4
53
50
0
30
20
1.49
136022766--136023176
225
1.8
224
99
0
813
37
13
21
27
1.90
136022225--136023719
766
2.0
765
94
0
2639
37
16
14
31
1.88
136022990--136025499
540
4.6
541
94
0
4391
37
17
11
33
1.86
136026203--136026266
31
2.1
31
90
0
101
23
25
15
35
1.94
136026458--136026597
23
6.0
24
91
7
209
25
22
22
30
1.99
136026457--136026597
47
3.0
47
90
8
209
25
21
21
30
1.99
136026648--136026706
20
3.0
19
90
2
91
33
20
11
33
1.89
136026749--136026796
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
136029474--136036821
536
13.7
541
96
2
13418
37
18
11
33
1.86
136038548--136038730
40
4.6
40
77
4
138
22
24
29
23
1.99
136042176--136042247
34
2.1
35
89
7
112
29
8
31
30
1.87
136049591--136049761
92
1.8
93
92
1
290
29
29
20
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
136049584--136049758
46
3.8
46
78
14
198
30
29
20
20
1.97
136053761--136053870
27
4.1
27
83
10
129
38
23
22
15
1.92
136053761--136053870
53
2.1
53
84
6
143
38
23
22
15
1.92
136061618--136061722
27
3.9
27
84
9
133
37
21
24
16
1.93
136061828--136061892
28
2.3
28
89
5
96
30
7
27
33
1.85
136067052--136067090
18
2.2
18
86
9
53
61
0
7
30
1.24
136069715--136069768
22
2.5
22
84
3
65
14
33
35
16
1.90
136073754--136073806
18
2.8
18
75
18
54
60
1
7
30
1.35
136081922--136082000
28
2.9
27
86
5
106
43
17
24
15
1.87
136081923--136082011
28
3.2
28
78
10
103
42
17
23
15
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770