genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.437.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  437  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
134760048--134760204	49	3.4	49	81	15	215	28	32	10	29	1.90
134763580--134763742	29	5.7	29	94	1	283	24	33	15	26	1.95
134763580--134763742	86	1.9	87	96	1	301	24	33	15	26	1.95
134763916--134764155	40	6.1	40	91	4	337	25	26	20	27	1.99
134763916--134764155	79	3.1	80	89	4	364	25	26	20	27	1.99
134765973--134766063	37	2.4	37	92	1	155	24	32	18	24	1.97
134766153--134766288	40	3.2	41	68	25	111	30	31	8	29	1.86
134766159--134766315	49	3.4	49	81	15	215	28	32	10	29	1.90
134769691--134769854	29	5.7	29	95	0	292	25	32	15	26	1.96
134770028--134770272	40	6.1	40	95	0	355	24	26	20	27	1.99
134772092--134772182	37	2.4	37	92	1	155	24	32	18	24	1.97
134772272--134772407	40	3.2	41	68	25	111	30	31	8	29	1.86
134772278--134772434	49	3.4	49	81	15	215	28	32	10	29	1.90
134776005--134776045	21	2.0	21	90	0	64	46	0	0	53	1.00
134776312--134776352	21	1.9	22	90	5	66	46	2	2	48	1.28
134782707--134782760	25	2.1	26	86	10	76	48	7	3	40	1.49
134786284--134786383	27	3.5	28	86	5	121	33	25	13	29	1.93
134791824--134791957	66	2.0	66	85	5	182	44	19	23	12	1.85
134792243--134792356	43	2.7	43	82	5	140	35	27	14	22	1.94
134792243--134792375	43	3.1	42	79	6	133	34	25	15	24	1.94
134792420--134792522	43	2.4	43	85	0	134	24	16	24	34	1.95
134795023--134795124	29	3.5	29	90	0	150	23	33	15	27	1.95
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
134802880--134802983	29	3.6	29	90	0	154	24	32	15	27	1.95
134807555--134807658	51	2.0	51	98	0	199	36	1	27	33	1.68
134812346--134812424	25	3.3	25	66	16	76	31	29	5	34	1.79
134812296--134812694	49	8.3	49	95	1	666	29	29	8	32	1.86
134816740--134817086	40	8.8	40	88	4	499	26	29	20	23	1.99
134816740--134817086	118	2.9	116	89	3	489	26	29	20	23	1.99
134819686--134819757	29	2.5	29	97	0	135	25	15	31	27	1.95
134819740--134819830	24	3.8	24	100	0	182	20	16	26	36	1.94
134819739--134819852	48	2.4	48	89	2	167	24	16	24	34	1.96
134827539--134827612	29	2.6	29	97	0	139	24	14	32	28	1.95
134827595--134827683	24	3.7	24	100	0	178	20	16	25	37	1.93
134830015--134830097	41	2.0	41	100	0	166	32	14	12	40	1.83
134831693--134831731	18	2.1	19	90	4	62	41	0	56	2	1.13
134839326--134839385	28	2.1	28	100	0	120	48	11	10	30	1.72
134841987--134842062	35	2.1	36	92	4	127	36	19	17	26	1.94
134846186--134846364	40	4.4	40	85	0	223	24	26	22	26	2.00
134849370--134849514	24	6.0	24	88	2	193	26	21	23	28	1.99
134849563--134849618	11	5.5	11	71	16	57	32	19	12	35	1.89
134849563--134849629	20	3.3	20	93	0	116	32	20	11	34	1.90
134853696--134853939	40	6.2	40	82	8	259	25	26	22	25	2.00
134861740--134861983	40	6.2	39	83	6	262	25	26	22	25	2.00
134869970--134870137	40	4.2	40	83	4	187	25	27	21	25	1.99
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
134869956--134870137	80	2.3	80	82	2	215	25	26	21	26	1.99
134877921--134877981	20	3.0	20	87	0	95	34	11	22	31	1.90
134878032--134878174	24	6.0	24	91	4	209	28	22	22	26	1.99
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134980998--134981227	100	2.3	99	85	4	311	29	27	17	24	1.98
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Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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