Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  654  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
205488075--205488234
29
5.5
29
82
4
180
25
31
16
26
1.97
205494993--205495112
42
2.9
42
80
7
138
27
24
14
34
1.94
205501071--205501280
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
205509201--205509355
39
4.0
40
95
4
275
25
21
30
23
1.99
205512530--205512669
39
3.5
39
88
4
201
28
25
22
22
1.99
205520927--205521069
40
3.6
40
83
3
157
27
25
22
24
2.00
205531903--205532112
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
205540039--205540248
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
205548674--205548775
29
3.5
29
90
0
150
23
33
15
27
1.95
205555892--205556015
43
2.9
43
76
4
135
31
24
14
29
1.94
205558488--205558533
23
2.0
23
83
4
58
50
15
2
32
1.56
205563651--205563835
40
4.6
40
83
7
248
22
22
28
25
1.99
205563655--205563835
83
2.2
80
87
3
247
22
23
29
25
1.99
205566910--205566955
18
2.6
18
96
0
83
45
21
21
10
1.82
205566904--205566955
9
5.7
9
74
2
50
48
23
19
9
1.78
205568455--205568481
12
2.2
12
100
0
54
37
48
0
14
1.45
205570044--205570161
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
205570012--205570175
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
205587672--205587701
15
1.9
16
93
6
53
0
6
16
76
0.99
205588271--205588424
45
3.5
44
79
4
157
28
24
20
25
1.99
205588644--205588783
44
3.2
43
66
8
122
28
22
23
25
1.99
205588897--205589125
44
5.2
44
66
15
143
24
22
17
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
205588881--205589183
88
3.5
87
87
3
412
23
22
18
35
1.96
205589328--205589651
42
7.5
42
68
11
125
25
23
23
27
2.00
205589546--205589741
45
4.5
43
67
8
126
27
26
20
25
1.99
205589171--205589832
131
5.1
131
90
1
1015
26
23
22
27
1.99
205589904--205590031
64
2.0
64
93
0
220
35
14
19
30
1.92
205591128--205591162
15
2.4
14
90
4
52
17
0
0
82
0.66
205591128--205591153
7
3.7
7
100
0
52
11
0
0
88
0.52
205598006--205598053
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
205598097--205598156
20
3.0
20
85
0
93
38
10
20
31
1.85
205598206--205598300
24
4.0
24
85
10
124
28
21
24
26
1.99
205598207--205598300
47
2.0
49
85
12
133
27
21
24
26
1.99
205598445--205598561
31
3.5
31
80
15
144
41
14
20
23
1.89
205598477--205598584
38
2.8
38
92
1
180
39
15
22
22
1.91
205609078--205609247
40
4.2
40
85
3
225
21
28
24
25
1.99
205612864--205613026
47
3.5
46
77
9
143
36
19
24
19
1.95
205613001--205613122
47
2.6
47
94
0
217
36
13
23
25
1.92
205613101--205613297
54
3.7
53
80
4
207
34
17
25
22
1.96
205613101--205613308
53
3.9
54
80
5
215
34
16
25
23
1.96
205616443--205616550
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
205618147--205618233
27
3.2
27
82
9
115
18
22
24
34
1.96
205623463--205623544
26
3.2
26
92
0
146
32
7
24
35
1.83
205625133--205625273
27
5.2
27
80
14
166
18
23
22
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
205625130--205625273
54
2.7
54
92
2
227
18
23
22
35
1.96
205625133--205625291
27
5.9
27
80
11
148
19
23
21
35
1.96
205625133--205625291
81
2.0
80
81
10
191
19
23
21
35
1.96
205638148--205638183
8
4.5
8
89
0
54
0
16
22
61
1.35
205638148--205638183
16
2.2
16
100
0
72
0
16
22
61
1.35
205638856--205638885
15
1.9
16
93
6
53
53
6
20
20
1.67
205642908--205642941
16
2.2
16
94
5
61
0
17
0
82
0.67
205642978--205643022
3
15.0
3
95
0
81
31
2
0
66
1.04
205648214--205648271
29
2.0
29
100
0
116
34
13
17
34
1.89
205650437--205650527
23
4.0
22
73
19
62
29
19
15
35
1.93
205650446--205650527
22
3.6
22
76
9
85
30
19
14
35
1.92
205654471--205654523
21
2.5
22
76
11
56
32
18
7
41
1.79
205657578--205657605
14
2.0
14
100
0
56
35
14
7
42
1.73
205658856--205658939
44
1.9
43
85
2
114
27
16
25
30
1.97
205660586--205660688
29
3.5
28
79
7
91
20
16
33
29
1.94
205672836--205673004
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
205679066--205679121
13
4.0
14
71
15
53
1
33
0
64
1.04
205681787--205681948
43
3.8
43
77
7
134
29
16
23
30
1.96
205685378--205685569
27
7.2
27
80
7
187
36
21
10
30
1.88
205685399--205685553
53
2.9
53
84
7
199
38
18
10
32
1.85
205685378--205685568
80
2.4
79
83
3
231
37
21
10
30
1.87
205685547--205685606
27
2.2
27
93
0
102
36
18
20
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
205685751--205685813
27
2.3
27
86
5
83
22
20
23
33
1.97
205685994--205686047
28
1.9
28
84
0
72
24
22
24
29
1.99
205686435--205686478
19
2.4
19
85
7
56
50
0
9
40
1.34
205690665--205690708
19
2.4
19
85
7
56
50
0
9
40
1.34
205694903--205694946
19
2.4
19
85
7
56
50
0
9
40
1.34
205700110--205700285
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
205700106--205700277
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
205703238--205703306
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
205703229--205703316
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
205705700--205705875
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
205705696--205705867
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
205708827--205708895
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
205708818--205708905
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
205711290--205711465
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
205711286--205711457
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
205714417--205714485
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
205714408--205714495
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
205716881--205717056
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
205716877--205717048
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
205720006--205720074
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
205719997--205720084
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
205722467--205722642
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
205722463--205722634
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
205725596--205725664
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
205725587--205725674
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
205728059--205728234
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
205728055--205728226
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
205737570--205737713
39
3.7
39
91
0
234
27
20
29
22
1.99
205737571--205737741
78
2.2
79
90
1
263
25
21
28
23
1.99
205742124--205742231
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
205750188--205750482
143
2.1
141
97
1
554
21
10
29
38
1.87
205751126--205751315
29
6.6
29
83
1
157
26
15
33
24
1.95
205758091--205758378
139
2.1
138
92
7
494
21
10
28
39
1.87
205759016--205759136
29
4.2
29
91
0
161
32
16
28
22
1.96
205759082--205759150
29
2.4
29
87
0
93
28
17
31
21
1.96
205762785--205762894
50
2.2
50
86
3
150
47
6
22
23
1.74
205762983--205763037
22
2.5
23
87
3
69
36
9
23
30
1.86
205762995--205763039
22
2.0
22
100
0
90
40
11
22
26
1.87
205764398--205764573
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
205764395--205764566
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
205771975--205772150
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
205771972--205772143
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
205780083--205780176
28
3.4
28
90
0
125
24
15
35
24
1.95
205781431--205781464
18
1.9
18
94
5
61
44
11
14
29
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
205783819--205784028
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
205793991--205794079
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
205793991--205794070
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
205794002--205794079
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
205797009--205797138
46
2.8
48
80
13
164
30
28
20
21
1.98
205797014--205797157
46
3.1
44
76
15
141
29
28
20
22
1.98
205800891--205801058
40
4.2
40
80
3
187
25
27
22
25
2.00
205800882--205801058
80
2.2
80
82
5
207
24
27
22
25
2.00
205801883--205801947
27
2.4
27
97
0
121
36
21
9
32
1.85
205806049--205806266
40
5.5
40
93
2
352
24
27
23
23
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770