Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  472  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
145730923--145731140
79
2.7
79
83
2
256
26
22
26
24
2.00
145730923--145731127
40
5.1
40
86
1
241
26
21
26
25
1.99
145736111--145736231
43
2.8
43
81
7
129
25
18
25
30
1.98
145738043--145738075
16
2.0
17
88
5
50
36
0
12
51
1.39
145741124--145741183
14
4.3
13
77
12
57
51
6
0
41
1.28
145741123--145741177
28
2.0
28
92
7
94
52
7
0
40
1.29
145752208--145752238
15
2.1
15
100
0
62
32
0
6
61
1.21
145764222--145764279
25
2.3
25
85
11
75
63
1
12
22
1.37
145768640--145768742
43
2.4
43
98
1
199
28
16
36
18
1.92
145768751--145768885
29
4.7
29
92
0
216
31
15
22
29
1.95
145776719--145776785
33
2.0
35
94
5
120
22
17
41
17
1.90
145776767--145776929
58
2.8
58
86
1
229
30
15
26
28
1.96
145776795--145776929
29
4.7
29
92
0
216
31
15
22
29
1.95
145781035--145781135
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
145781035--145781211
40
4.5
40
82
4
180
28
22
25
23
1.99
145789057--145789236
40
4.5
39
77
10
161
27
22
26
23
1.99
145794659--145794759
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
145802610--145802710
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
145805811--145805872
28
2.2
28
82
2
72
38
25
11
24
1.88
145812486--145812598
43
2.6
42
84
5
129
28
16
23
31
1.96
145817238--145817307
27
2.6
27
97
2
131
31
27
12
28
1.93
145821591--145821655
29
2.2
29
94
0
112
30
15
27
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
145821756--145821788
2
16.5
2
93
0
57
45
0
3
51
1.16
145829693--145829723
2
15.5
2
93
0
53
45
0
3
51
1.17
145833505--145833686
40
4.6
40
91
1
276
24
20
28
26
1.99
145833495--145833706
80
2.7
80
88
2
311
23
20
28
27
1.99
145836916--145837018
29
3.6
29
80
2
91
25
33
17
24
1.96
145838177--145838231
17
3.1
17
77
10
65
5
12
1
80
0.97
145844789--145844891
29
3.6
29
80
2
91
25
33
17
24
1.96
145846051--145846105
20
3.0
18
82
17
69
5
14
1
78
1.02
145847518--145847591
28
2.6
28
80
0
85
22
24
18
33
1.97
145847605--145847690
40
2.2
39
85
2
109
29
27
17
25
1.97
145852994--145853019
3
8.7
3
100
0
52
30
34
0
34
1.58
145860020--145860102
41
2.0
41
95
0
148
34
16
7
40
1.76
145862068--145862240
46
3.7
46
74
10
172
29
25
19
25
1.99
145863742--145863895
27
5.5
27
82
4
173
28
14
25
31
1.95
145863792--145863895
55
1.9
55
100
0
208
26
13
24
35
1.92
145871600--145871753
27
5.5
27
82
4
173
28
14
25
31
1.95
145871650--145871753
55
1.9
55
100
0
208
26
13
24
35
1.92
145873580--145873638
30
2.0
30
89
0
91
28
25
8
37
1.85
145874623--145874749
47
2.7
48
79
17
149
26
18
29
25
1.98
145874623--145874779
46
3.4
46
79
9
158
28
17
28
25
1.98
145874671--145874822
46
3.3
44
81
11
119
26
17
30
25
1.97
145876995--145877136
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
145877034--145877162
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
145889360--145889511
40
3.8
39
84
1
151
23
26
23
26
2.00
145889360--145889511
80
1.9
80
83
5
200
23
26
23
26
2.00
145891355--145891390
2
18.0
2
94
0
63
47
0
2
50
1.15
145891564--145891673
6
17.8
6
69
15
64
19
19
12
49
1.79
145891595--145891661
25
2.7
25
95
0
116
19
22
11
46
1.82
145891564--145891661
31
3.4
30
76
16
107
19
19
13
47
1.81
145894764--145894889
56
2.3
55
91
2
198
26
15
23
34
1.95
145894767--145894929
56
2.9
55
84
8
188
28
15
23
32
1.95
145900151--145900323
46
3.7
46
75
14
185
22
19
27
31
1.98
145900148--145900318
93
1.8
93
91
2
281
22
19
28
30
1.98
145905693--145905844
40
3.8
40
91
1
234
22
21
28
27
1.99
145905693--145905864
40
4.3
40
88
2
222
23
21
27
27
1.99
145908189--145908751
48
11.7
48
94
0
928
35
5
27
31
1.81
145908898--145909000
37
2.8
37
86
0
152
25
20
32
22
1.98
145910284--145910642
40
9.0
40
95
0
637
21
22
29
26
1.99
145910806--145910856
25
2.0
25
81
7
59
35
13
29
21
1.92
145913833--145914353
48
10.9
48
96
2
890
34
6
28
30
1.82
145913961--145914089
28
5.2
28
58
27
74
35
6
29
28
1.82
145914494--145914596
37
2.8
37
90
0
152
24
19
31
25
1.98
145918778--145918927
40
3.7
42
81
7
132
22
25
24
28
2.00
145918759--145918963
80
2.6
80
81
2
216
22
25
23
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
145918827--145919018
40
4.8
40
82
0
213
25
26
22
26
2.00
145921804--145921869
27
2.4
28
89
2
98
28
13
28
28
1.94
145924209--145924273
29
2.2
29
94
0
112
30
16
27
24
1.97
145930880--145930941
25
2.5
24
80
10
72
74
1
17
6
1.11
145932108--145932172
29
2.2
29
94
0
112
30
16
27
24
1.97
145938534--145938593
27
2.3
26
82
2
66
36
18
21
23
1.95
145938632--145938683
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
145939283--145939334
27
2.0
26
84
3
68
28
17
21
32
1.96
145942913--145943034
46
2.6
47
84
5
147
26
22
14
36
1.93
145950228--145950344
46
2.6
46
88
1
173
25
23
15
35
1.94
145955875--145955934
27
2.3
26
80
8
68
35
18
23
23
1.96
145959060--145959184
29
4.3
29
85
5
164
27
13
28
30
1.94
145961149--145961200
27
1.9
27
96
0
95
30
26
3
38
1.74
145961196--145961385
27
7.1
27
76
8
129
40
19
9
30
1.83
145961236--145961468
54
4.3
54
75
5
191
40
18
9
32
1.82
145961236--145961469
109
2.2
107
84
3
290
40
18
8
32
1.82
145961236--145961449
27
7.9
27
80
5
153
40
17
9
33
1.81
145962384--145962442
25
2.4
24
83
10
75
30
22
22
25
1.99
145962577--145962710
42
3.2
42
96
0
250
31
14
19
34
1.92
145962734--145962817
31
2.7
31
96
1
152
29
17
25
27
1.98
145965229--145965408
40
4.6
40
89
2
249
26
30
21
22
1.99
145968302--145968393
27
3.4
27
83
5
123
28
23
7
40
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
145968289--145968393
54
1.9
54
82
3
131
32
22
7
37
1.83
145968385--145968575
27
7.1
26
76
10
120
38
21
10
28
1.87
145968425--145968576
54
2.8
55
79
5
177
40
21
8
29
1.82
145969561--145969629
25
2.8
24
93
2
111
24
27
23
24
2.00
145969561--145969642
24
3.4
24
89
5
112
28
24
23
24
2.00
145969561--145969654
49
1.9
49
80
8
111
26
25
23
24
2.00
145969777--145969910
42
3.2
42
98
0
259
31
15
20
32
1.94
145969934--145970048
31
3.7
31
90
3
180
29
15
25
29
1.96
145971675--145971708
16
2.1
16
88
0
50
11
11
2
73
1.20
145977853--145977991
47
3.0
47
88
0
197
32
11
29
26
1.91
145977880--145977955
23
3.2
25
62
24
63
28
13
34
23
1.92
145978154--145978341
37
5.1
37
92
1
261
21
19
31
27
1.97
145978154--145978341
73
2.5
73
89
3
279
21
19
31
27
1.97
145980292--145980389
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
145995804--145995987
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
145995844--145996032
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
145998737--145998870
29
4.6
29
77
7
74
25
32
16
26
1.96
145998774--145998955
87
2.1
87
90
2
276
24
31
14
29
1.95
145998796--145998955
29
5.5
29
94
0
275
25
30
14
30
1.95
146004080--146004471
27
14.7
27
79
2
396
38
20
10
30
1.87
146004080--146004473
106
3.7
108
84
2
481
38
20
10
30
1.87
146004080--146004471
81
4.9
81
81
2
441
38
20
10
30
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
146004450--146004540
27
3.4
27
82
0
101
39
17
14
28
1.89
146008551--146008649
28
3.5
28
87
4
119
27
15
27
30
1.96
146016292--146016390
28
3.5
28
86
4
110
27
16
27
29
1.97
146026315--146026411
40
2.4
40
78
0
104
23
13
27
35
1.92
146029612--146029824
79
2.7
77
81
6
228
27
26
21
25
1.99
146029612--146029824
40
5.4
40
82
6
227
27
26
21
25
1.99
146037726--146037933
40
5.2
40
85
2
258
26
26
21
25
1.99
146047846--146047898
23
2.2
24
96
3
99
7
30
43
18
1.78
146049441--146049665
40
5.6
40
81
6
249
26
28
21
23
1.99
146049467--146049665
83
2.4
83
83
4
253
27
29
21
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770