Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  610  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
190879681--190879873
29
6.7
29
96
0
341
26
16
32
24
1.96
190882659--190882715
30
2.0
30
83
16
77
31
15
3
49
1.62
190890482--190890578
30
3.2
30
76
2
97
27
26
16
28
1.97
190893148--190893221
5
14.0
5
78
14
62
74
4
18
2
1.10
190893148--190893219
21
3.4
21
76
19
69
75
4
18
2
1.09
190893290--190893314
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
190893284--190893339
18
3.1
18
76
5
51
69
3
19
7
1.27
190893290--190893371
30
2.7
31
81
5
105
64
2
21
10
1.37
190895585--190895681
30
3.2
30
73
2
97
27
26
16
28
1.97
190896580--190896628
20
2.3
22
86
10
66
34
8
14
42
1.75
190897523--190897634
39
2.9
39
90
0
179
22
20
27
29
1.98
190899135--190899332
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
190899201--190899318
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
190899169--190899332
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
190909604--190909648
20
2.2
20
88
0
63
51
2
11
35
1.50
190925536--190925604
34
2.0
34
94
0
120
47
20
0
31
1.50
190925541--190925614
34
2.2
34
85
4
96
51
20
0
28
1.48
190926931--190926960
14
2.1
14
93
0
51
43
0
10
46
1.37
190928078--190928127
25
2.0
26
84
7
68
24
36
4
36
1.74
190938554--190938684
30
4.5
30
85
4
169
32
13
25
28
1.94
190938554--190938684
58
2.2
59
86
1
174
32
13
25
28
1.94
190945928--190946099
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
190945920--190946095
46
3.8
46
80
12
225
28
28
21
21
1.98
190948463--190948551
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
190948463--190948542
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
190948474--190948551
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
190951495--190951666
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
190951487--190951662
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
190955284--190955449
40
4.2
40
78
8
160
26
22
27
24
2.00
190963283--190963449
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
190971282--190971448
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
190973009--190973070
26
2.3
26
83
8
81
38
27
6
27
1.81
190973175--190973290
28
4.2
28
84
2
146
21
22
20
35
1.96
190982415--190982510
48
2.0
48
95
0
174
36
18
6
38
1.76
190991049--190991194
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
190991081--190991232
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190999160--190999305
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3.7
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190999192--190999343
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22
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0
45
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191007284--191007373
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3.2
28
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103
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23
24
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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57
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22
19
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1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
85
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3
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28
14
31
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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90
3
234
27
21
21
29
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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