Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  254  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76207937--76208676
88
9.2
76
73
15
428
28
16
18
36
1.93
76208318--76208356
14
2.8
14
88
0
60
30
12
5
51
1.62
76208448--76208509
30
2.1
30
90
6
99
19
9
29
41
1.83
76208101--76208677
254
2.3
247
85
5
754
27
16
18
36
1.93
76209322--76209355
15
2.3
15
90
5
52
88
2
8
0
0.62
76209351--76209385
16
2.3
16
90
9
56
62
31
0
5
1.18
76212255--76212297
18
2.3
18
88
4
59
86
0
9
4
0.71
76213185--76213218
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
76213486--76213523
19
2.0
19
94
0
67
31
23
10
34
1.89
76214920--76214996
31
2.4
33
87
6
106
55
5
3
35
1.40
76214945--76214995
25
1.9
28
84
11
72
60
1
1
35
1.19
76215331--76215438
29
3.7
29
76
19
107
66
0
0
31
1.04
76215188--76215412
16
13.8
16
66
25
77
58
1
4
35
1.30
76215350--76215438
47
1.9
47
86
4
128
67
1
1
30
1.05
76216763--76216788
9
2.9
9
100
0
52
11
23
42
23
1.86
76228197--76228245
23
2.3
21
82
10
64
61
0
2
36
1.08
76228178--76228248
29
2.3
32
88
9
103
56
2
4
36
1.34
76228341--76228373
14
2.4
14
90
10
50
63
3
3
30
1.24
76228443--76228649
7
28.9
7
63
23
58
57
1
4
35
1.31
76228589--76228668
24
3.2
27
79
16
91
65
1
1
32
1.09
76228589--76228675
29
3.0
29
81
8
99
65
1
1
32
1.07
76237439--76237483
22
2.0
22
91
0
72
35
6
24
33
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76247255--76247549
78
3.8
78
84
3
378
33
17
22
26
1.96
76247624--76247690
31
2.2
31
91
0
107
22
10
32
34
1.88
76247579--76247732
76
2.0
76
87
2
220
27
13
30
28
1.94
76248099--76248161
18
3.5
19
85
8
87
39
7
17
34
1.79
76248099--76248153
18
2.9
19
89
5
94
38
9
16
36
1.80
76248099--76248176
18
3.8
22
83
10
71
37
7
16
38
1.78
76248443--76248478
19
2.0
17
89
10
54
33
0
0
66
0.92
76250276--76250321
21
2.2
20
88
3
65
32
0
0
67
0.91
76251528--76251565
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
76264813--76264912
42
2.5
38
76
15
96
31
23
20
26
1.98
76266488--76266532
22
2.0
22
100
0
90
33
13
26
26
1.93
76269495--76269599
37
2.8
37
94
0
174
27
29
17
25
1.97
76269750--76269934
48
3.8
48
90
4
300
31
26
6
35
1.82
76269750--76269933
98
1.9
97
92
4
309
30
26
6
35
1.82
76269904--76270097
47
4.1
47
88
0
271
26
28
10
34
1.89
76269997--76270068
22
3.1
22
64
24
58
23
29
13
33
1.93
76275307--76275349
22
2.0
22
85
0
59
6
23
2
67
1.27
76276594--76276703
27
4.1
27
81
8
125
15
22
22
39
1.92
76276594--76276703
54
2.0
54
85
3
150
15
22
22
39
1.92
76285425--76285470
2
23.0
2
100
0
92
50
0
0
50
1.00
76285819--76285851
17
2.1
16
88
11
50
30
0
0
69
0.88
76285898--76285943
21
2.1
23
88
8
69
21
0
6
71
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76286721--76286746
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
76288691--76288716
13
2.0
13
100
0
52
23
15
15
46
1.83
76293451--76293502
20
2.6
20
81
6
61
48
11
5
34
1.63
76293470--76293539
30
2.3
30
87
4
106
47
8
5
38
1.58
76293470--76293555
30
2.8
30
82
8
104
48
10
5
34
1.61
76296713--76296872
19
8.8
19
85
9
219
36
16
11
36
1.84
76296782--76296815
14
2.4
14
90
0
59
35
14
11
38
1.83
76297306--76297495
44
4.3
44
73
12
138
29
24
16
29
1.96
76297370--76297589
46
4.8
46
72
11
157
26
23
17
32
1.97
76297282--76297589
134
2.3
134
89
0
454
27
24
16
31
1.96
76297612--76298377
44
17.4
44
71
16
441
29
26
15
28
1.96
76297612--76298391
132
5.9
129
76
12
496
29
26
15
28
1.96
76297634--76298246
176
3.5
176
92
0
987
28
26
15
29
1.96
76297612--76298376
352
2.2
347
80
8
904
29
26
15
28
1.96
76299336--76299379
22
2.0
21
91
4
70
6
6
0
86
0.71
76299340--76299378
20
2.0
20
90
10
62
5
7
0
87
0.68
76305043--76305117
22
3.6
21
77
11
57
41
18
6
33
1.77
76305079--76305259
19
9.8
19
88
7
284
37
16
11
35
1.84
76305079--76305259
54
3.3
54
93
2
299
37
16
11
35
1.84
76305072--76305255
73
2.5
74
87
6
279
36
16
10
35
1.84
76310378--76310544
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
76318370--76318536
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76321278--76321354
27
2.9
27
81
9
95
35
15
24
24
1.94
76333730--76333757
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
76334455--76334640
40
4.7
40
86
5
218
25
23
26
24
2.00
76334455--76334673
80
2.8
80
79
12
229
26
22
26
24
2.00
76337102--76337284
40
4.6
40
81
6
196
26
22
25
25
2.00
76337102--76337284
80
2.3
80
84
6
221
26
22
25
25
2.00
76337956--76339375
712
2.0
708
92
0
2374
33
15
22
28
1.94
76346315--76346453
24
5.8
24
98
0
260
20
17
26
35
1.94
76346314--76346475
72
2.2
72
90
2
245
22
17
25
34
1.96
76354092--76354230
24
5.8
24
94
0
242
20
18
26
34
1.96
76354095--76354252
48
3.3
48
84
7
205
22
18
25
32
1.97
76354091--76354252
72
2.2
72
90
2
245
22
18
25
33
1.97
76357874--76357941
26
2.5
28
90
7
113
27
14
27
29
1.95
76365264--76365412
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
76365305--76365412
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
76373293--76373441
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
76373334--76373441
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
76382076--76383215
571
2.0
571
98
0
2226
33
11
21
34
1.89
76383194--76383262
21
3.1
21
64
18
50
24
13
23
39
1.90
76385383--76385537
25
6.3
24
77
5
107
22
28
16
32
1.96
76398499--76398617
25
4.8
25
79
0
130
21
28
19
30
1.98
76398499--76398636
50
2.8
49
75
7
127
23
27
18
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76404059--76404164
54
2.0
54
96
0
194
39
16
16
27
1.90
76406969--76407086
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
76406937--76407100
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
76418268--76418373
28
3.8
28
83
0
122
20
22
18
37
1.94
76425716--76425844
48
2.7
48
93
0
213
19
17
29
33
1.95
76433180--76433345
38
4.3
38
80
5
154
21
21
25
31
1.98
76445833--76445892
29
2.1
29
93
0
102
46
8
23
21
1.78
76446212--76446245
3
11.3
3
100
0
68
35
0
0
64
0.94
76447571--76447621
21
2.4
22
87
9
70
3
27
5
62
1.36
76448746--76448888
37
3.9
37
93
0
223
26
32
17
23
1.97
76448993--76449327
47
7.1
47
93
1
512
25
28
11
34
1.91
76449202--76449279
25
3.2
25
64
29
69
29
29
10
30
1.90
76453278--76453347
27
2.5
28
93
2
115
27
14
28
30
1.95
76461627--76461682
21
2.7
21
77
0
58
14
28
30
26
1.95
76461731--76461926
97
2.0
97
93
2
331
14
14
25
45
1.82
76462676--76462734
29
2.0
29
96
0
109
40
13
11
33
1.81
76468207--76468431
124
1.8
124
84
1
308
30
10
24
35
1.89
76468426--76468555
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
76474113--76474185
29
2.5
29
93
0
101
26
31
16
26
1.96
76482241--76482314
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
76482298--76482371
27
2.6
29
78
8
89
22
20
35
21
1.96
76490104--76490177
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76490161--76490236
29
2.6
29
78
0
89
22
19
35
22
1.96
76490104--76490236
58
2.3
58
80
2
133
24
17
33
24
1.96
76492871--76493034
72
2.3
72
94
4
289
18
28
18
34
1.95
76500405--76500568
71
2.3
71
97
0
310
18
28
18
34
1.95
76500405--76500602
71
2.8
70
90
3
249
20
28
17
32
1.96
76509631--76509726
42
2.3
43
83
5
124
30
18
23
27
1.98
76512455--76512597
39
3.7
39
90
2
234
26
20
30
22
1.99
76512456--76512637
77
2.3
79
89
2
269
24
22
29
23
1.99
76520481--76520624
39
3.7
39
90
0
234
26
21
29
22
1.99
76520482--76520664
78
2.3
79
89
1
269
24
22
29
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770