Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  152  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44701769--44701997
40
5.8
39
80
7
205
26
28
22
23
1.99
44703675--44703725
23
2.2
23
96
0
93
15
17
17
49
1.81
44709032--44709216
40
4.7
40
90
1
255
26
27
23
22
2.00
44709032--44709213
79
2.3
80
88
0
258
26
28
22
23
1.99
44709032--44709253
79
2.8
78
85
6
252
26
28
22
22
1.99
44709025--44709253
40
5.8
39
80
7
205
26
28
22
23
1.99
44714084--44714125
17
2.4
18
80
4
59
73
2
16
7
1.15
44715444--44715682
40
6.1
39
82
9
258
24
22
27
25
2.00
44715444--44715661
76
2.8
78
83
9
268
23
22
27
26
2.00
44715445--44715663
39
5.6
40
82
11
251
23
22
27
26
1.99
44723544--44723772
40
5.8
41
82
7
260
23
21
28
26
1.99
44723549--44723805
79
3.3
78
78
8
191
24
21
27
26
1.99
44726469--44726712
43
5.7
42
71
11
160
27
26
20
26
1.99
44726465--44726712
85
2.9
85
86
3
322
27
26
20
26
1.99
44726561--44726707
43
3.5
42
75
9
163
27
26
19
26
1.99
44728895--44729077
40
4.7
39
81
8
203
25
27
21
24
1.99
44728895--44729077
78
2.3
80
80
8
214
25
27
21
24
1.99
44733850--44734021
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
44733842--44734017
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
44736401--44736489
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
44736401--44736480
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
44736412--44736489
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44739442--44739613
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
44739434--44739609
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
44741989--44742077
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
44741989--44742068
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
44742000--44742077
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
44744983--44745156
46
3.8
46
79
13
214
28
29
21
20
1.98
44744991--44745161
92
1.8
93
94
1
308
28
29
21
20
1.98
44757917--44758065
71
2.1
71
100
0
298
19
28
17
34
1.94
44759676--44759787
40
2.8
40
82
8
138
23
24
28
24
2.00
44768838--44769025
40
4.7
40
92
0
315
26
22
27
23
1.99
44776866--44777059
40
4.9
40
87
0
273
26
21
27
24
1.99
44778625--44778766
40
3.6
40
88
2
198
28
26
21
23
1.99
44787138--44787319
40
4.6
40
88
2
269
27
25
22
24
2.00
44790355--44790402
21
2.2
22
77
3
53
27
22
6
43
1.77
44790330--44790560
115
2.0
115
96
0
426
33
22
10
32
1.89
44792326--44792655
48
6.9
48
79
5
292
26
18
28
27
1.98
44792325--44792657
143
2.3
145
84
5
449
26
18
27
27
1.98
44793440--44793527
40
2.2
40
85
0
113
14
22
30
31
1.94
44800121--44800193
35
2.1
35
97
0
137
35
13
9
41
1.77
44800365--44800453
42
2.1
43
85
2
117
37
25
14
22
1.92
44801523--44801563
21
2.0
21
85
9
57
51
17
7
24
1.70
44803886--44803936
25
2.0
25
96
0
93
37
25
5
31
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44808538--44808681
39
3.6
39
87
0
189
24
31
21
22
1.98
44810527--44810631
43
2.4
43
90
0
156
34
17
20
28
1.95
44817908--44818074
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
44817908--44818074
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
44818899--44818944
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
44825910--44826076
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
44825910--44826076
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
44826901--44826946
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
44833332--44833398
20
3.3
20
87
4
91
35
11
19
32
1.88
44833448--44833522
28
2.8
26
78
15
80
26
25
21
26
1.99
44833749--44833812
31
2.1
31
93
0
110
39
15
20
25
1.92
44842568--44842621
20
2.7
20
94
0
90
35
14
20
29
1.93
44842673--44842874
24
8.4
24
92
0
314
28
19
22
28
1.98
44845283--44845394
38
2.9
39
90
4
172
23
21
32
23
1.98
44855344--44855473
40
3.2
40
80
4
156
23
24
27
23
2.00
44857149--44857196
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
44857240--44857298
20
3.0
20
89
0
91
33
10
22
33
1.87
44857349--44857588
24
10.0
24
92
1
347
28
20
22
28
1.99
44859199--44859265
20
3.3
20
89
4
100
34
11
19
34
1.88
44859314--44859386
27
2.8
26
93
4
121
27
24
23
24
2.00
44859314--44859395
25
3.2
25
75
16
78
31
21
21
24
1.98
44859613--44859714
31
3.1
31
76
17
114
40
12
20
26
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44859630--44859737
38
2.9
38
92
1
182
41
12
19
26
1.86
44861435--44861463
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
44867122--44867223
43
2.4
43
86
0
141
32
13
19
34
1.91
44871959--44872021
22
2.9
22
73
15
60
20
26
39
12
1.89
44873127--44873294
47
3.6
45
73
10
131
24
28
18
28
1.98
44875219--44875406
95
2.0
95
97
0
358
28
27
13
31
1.94
44880922--44881027
54
2.0
54
94
0
185
19
20
29
30
1.97
44880973--44881085
40
2.8
40
90
4
167
23
22
28
26
1.99
44881097--44881264
57
2.9
57
87
0
237
24
18
26
30
1.98
44881101--44881257
28
5.5
28
74
6
136
23
19
26
30
1.98
44893300--44893452
46
3.3
45
77
11
166
24
28
17
28
1.97
44896364--44896534
92
1.8
93
94
1
308
28
29
21
20
1.98
44896357--44896531
46
3.8
46
78
14
207
29
29
21
20
1.98
44903904--44904075
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
44903897--44904072
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
44907878--44907935
29
2.0
29
100
0
116
31
13
27
27
1.94
44907881--44907942
29
2.1
29
93
0
106
32
17
24
25
1.97
44914148--44914234
39
2.2
39
91
0
138
28
26
21
22
1.99
44914468--44914565
49
2.0
49
97
0
187
30
21
6
41
1.77
44922337--44922485
40
3.7
40
78
8
135
23
22
28
24
1.99
44926830--44927005
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
44926827--44926998
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44934371--44934546
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
44934368--44934539
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
44940699--44940971
40
6.8
40
81
1
269
27
22
26
23
1.99
44940699--44940929
80
2.9
80
92
1
365
26
22
27
23
1.99
44940709--44940929
120
1.8
121
86
2
320
27
21
26
24
1.99
44940699--44940971
80
3.4
80
89
1
359
27
22
26
23
1.99
44940697--44940957
120
2.2
121
80
6
314
27
22
26
24
2.00
44944318--44944469
40
3.8
40
78
8
132
23
23
27
25
2.00
44947590--44947676
39
2.2
39
91
4
140
27
25
24
22
2.00
44963029--44963098
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
44968986--44969189
40
5.1
39
89
2
264
23
19
28
28
1.98
44969985--44970021
18
2.1
18
100
0
74
54
0
10
35
1.36
44972680--44972822
57
2.5
57
80
6
164
30
19
19
30
1.97
44984010--44984079
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
44984010--44984091
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
44991815--44991884
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
44991815--44991896
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
44997629--44997757
64
2.0
64
100
0
258
35
10
20
33
1.87
45005070--45005242
46
3.7
46
78
14
194
21
20
27
30
1.98
45005067--45005237
93
1.8
93
92
2
290
21
20
28
29
1.98
45012585--45012743
42
3.6
42
71
12
122
27
19
26
26
1.99
45012583--45012753
90
1.9
90
83
0
225
26
19
25
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45015937--45016206
47
5.7
47
89
4
380
29
31
7
32
1.84
45015937--45016206
96
2.8
96
88
5
372
29
31
7
32
1.84
45015937--45016206
143
1.9
143
90
1
434
29
31
7
32
1.84
45038305--45038549
78
3.1
78
89
3
350
26
29
20
23
1.99
45038305--45038549
40
6.2
40
90
4
356
26
29
20
23
1.99
45046545--45046752
40
5.2
40
90
1
303
26
28
21
23
1.99
45053222--45053396
40
4.4
40
89
4
264
31
28
18
22
1.97
45058438--45058806
48
7.7
48
96
0
661
29
28
6
35
1.82
45064911--45065074
44
3.5
45
80
9
179
28
18
29
23
1.98
45069513--45069680
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770