Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  153  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45077529--45077695
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
45079723--45079906
68
2.7
68
88
6
250
33
14
28
23
1.94
45079783--45079980
68
2.9
68
81
10
192
34
15
28
21
1.94
45085786--45085843
30
1.9
30
92
0
98
31
12
25
31
1.92
45086182--45086399
47
4.7
46
77
10
178
27
21
29
21
1.99
45086182--45086399
94
2.4
91
82
8
237
27
21
29
21
1.99
45091725--45091837
42
2.7
42
72
10
113
34
24
13
27
1.93
45091700--45091950
43
5.9
42
71
7
175
32
23
18
25
1.97
45091699--45091923
85
2.6
84
86
4
290
32
23
18
25
1.97
45112412--45112450
20
2.0
20
84
0
51
41
2
10
46
1.51
45122317--45122343
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
45123255--45123325
35
2.0
35
100
0
142
32
33
8
25
1.86
45131437--45131499
30
2.1
29
83
16
76
14
19
15
50
1.77
45137138--45137350
38
5.6
38
87
0
302
22
21
24
30
1.99
45137369--45137494
46
2.9
45
82
10
138
24
22
29
23
1.99
45138755--45138849
48
2.0
48
83
8
122
32
20
27
20
1.97
45141121--45141428
38
8.1
38
88
0
427
22
21
23
32
1.98
45141429--45141554
46
2.9
44
82
6
139
22
22
30
25
1.99
45142533--45142672
60
2.3
60
80
9
151
26
19
27
27
1.99
45149074--45149251
39
4.6
39
82
6
143
28
29
22
20
1.98
45149106--45149269
78
2.1
78
83
5
199
26
29
22
20
1.99
45149154--45149267
39
2.9
39
96
0
201
27
30
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45149709--45149740
2
16.5
2
93
6
57
53
0
0
46
1.00
45154564--45154711
51
2.9
51
91
2
235
29
26
13
30
1.94
45157028--45157203
46
3.8
46
77
11
180
22
20
27
29
1.98
45157025--45157196
93
1.8
93
88
2
265
22
20
27
28
1.99
45158643--45158769
48
2.9
42
78
16
130
29
25
18
26
1.98
45158669--45158849
48
3.8
48
94
0
281
29
25
18
27
1.98
45158822--45158909
37
2.4
37
75
7
90
30
25
14
29
1.95
45158850--45158983
37
3.6
37
86
6
164
29
23
17
28
1.97
45159872--45160013
27
5.3
27
89
1
196
35
19
20
24
1.96
45160135--45160177
11
4.0
11
81
6
61
34
13
18
32
1.90
45160137--45160185
21
2.3
21
96
0
89
34
10
18
36
1.85
45160233--45160327
25
3.8
25
94
0
163
26
26
22
25
2.00
45169732--45169948
114
1.9
114
96
0
398
29
11
14
44
1.80
45169958--45169982
8
3.1
8
100
0
50
36
12
12
40
1.79
45176458--45176678
40
5.6
40
85
6
254
22
21
28
27
1.99
45176458--45176678
80
2.8
79
88
2
302
22
21
28
27
1.99
45193420--45193586
43
3.9
44
84
4
216
27
14
25
32
1.94
45193853--45193898
19
2.3
20
92
3
76
26
10
15
47
1.78
45196648--45196679
12
2.7
12
95
0
55
50
0
50
0
1.00
45198023--45198185
43
3.8
43
90
0
245
26
13
25
34
1.93
45198022--45198212
43
4.5
41
86
4
163
27
13
23
35
1.92
45199689--45199758
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45200470--45200585
58
2.0
58
100
0
232
37
29
5
27
1.78
45209108--45209306
43
4.6
44
84
3
226
27
14
24
34
1.94
45211132--45211161
8
3.8
8
90
0
51
60
23
13
3
1.48
45211522--45211607
27
3.2
26
86
4
109
17
22
20
39
1.92
45217003--45217093
25
3.6
25
82
5
112
25
19
24
30
1.98
45217735--45217778
20
2.2
20
84
8
54
59
4
15
20
1.54
45218170--45218208
20
2.0
20
90
10
62
12
5
30
51
1.62
45221981--45222049
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
45226266--45226334
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
45231157--45231267
47
2.4
47
84
6
154
35
23
16
25
1.95
45232030--45232058
4
7.2
4
100
0
58
0
24
0
75
0.80
45236558--45236620
27
2.4
28
91
5
96
20
9
25
44
1.82
45236568--45236624
27
2.1
27
100
0
114
17
12
22
47
1.81
45238249--45238286
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
45244535--45244603
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
45246228--45246265
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
45247439--45247512
37
1.9
38
91
5
123
35
13
18
32
1.90
45247439--45247519
20
4.2
20
87
9
123
34
12
20
32
1.90
45247564--45247680
24
5.0
24
81
12
136
29
21
22
27
1.99
45247564--45247680
45
2.5
46
83
10
123
29
21
22
27
1.99
45247869--45247926
30
2.1
29
87
12
86
39
15
22
22
1.91
45254085--45254132
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45254176--45254259
20
4.2
20
90
0
132
34
10
22
32
1.89
45254306--45254472
23
7.1
23
94
2
271
27
22
21
28
1.99
45254304--45254493
24
8.0
24
91
4
271
27
23
22
27
1.99
45254304--45254493
71
2.7
70
90
4
283
27
23
22
27
1.99
45254685--45254747
30
2.1
31
93
3
110
39
15
22
22
1.92
45257348--45257499
40
3.8
40
82
3
162
26
22
27
23
1.99
45262535--45262639
25
4.3
25
69
8
81
23
23
16
36
1.94
45264837--45264875
19
2.1
19
100
0
78
35
20
5
38
1.75
45267373--45267448
40
1.9
40
88
0
116
34
28
14
22
1.93
45269511--45269645
52
2.6
52
83
6
177
30
28
13
27
1.94
45276180--45276239
3
19.0
3
74
16
50
61
3
1
33
1.22
45276180--45276212
10
3.3
10
84
16
50
60
0
3
36
1.12
45276180--45276223
17
2.6
18
85
7
56
63
0
2
34
1.07
45276178--45276260
42
2.1
42
82
13
104
61
2
1
34
1.17
45276138--45276223
20
4.3
20
72
20
65
61
0
6
31
1.22
45276282--45276318
19
2.0
19
89
5
58
59
0
5
35
1.20
45287875--45287983
26
4.2
26
96
2
184
33
5
23
36
1.78
45287875--45287983
51
2.1
52
93
1
184
33
5
23
36
1.78
45289598--45289757
26
6.2
26
83
11
195
16
24
22
36
1.94
45289602--45289756
76
2.0
78
84
9
203
17
24
21
36
1.95
45295007--45295090
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
45296530--45296604
26
2.8
26
85
4
87
34
21
12
32
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45296707--45296870
27
6.2
27
85
9
203
18
24
23
34
1.96
45296705--45296870
52
3.1
53
86
4
228
18
24
23
34
1.96
45297966--45298069
49
2.1
49
87
3
156
27
39
18
14
1.89
45301598--45301728
40
3.3
40
78
2
147
25
23
27
23
2.00
45306067--45306101
8
4.4
8
100
0
70
22
0
11
65
1.24
45323430--45323462
14
2.4
14
90
10
50
39
0
0
60
0.97
45326528--45326622
40
2.4
40
84
3
122
36
37
13
11
1.81
45329724--45329771
23
2.1
23
92
0
78
25
25
8
41
1.83
45331014--45331048
13
2.7
13
90
0
52
51
2
8
37
1.47
45337198--45337257
15
4.0
15
72
8
50
11
21
15
51
1.74
45337907--45337936
15
2.1
15
93
6
53
10
13
20
56
1.65
45340554--45340592
12
3.2
12
88
0
60
38
10
2
48
1.51
45362022--45362054
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
45362140--45362264
23
5.2
25
64
30
85
28
29
10
31
1.90
45362118--45362684
47
12.1
47
94
0
954
26
28
12
32
1.92
45362165--45362239
22
3.3
22
66
29
57
26
30
12
30
1.92
45362447--45362568
22
5.3
22
62
27
56
25
29
13
31
1.94
45376879--45376936
5
11.4
5
73
23
50
18
5
0
75
0.98
45376878--45376926
6
8.5
6
80
13
50
16
4
0
79
0.88
45379856--45379888
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
45388840--45388966
61
2.1
61
83
2
157
22
18
31
26
1.97
45398115--45398287
43
4.0
43
81
1
195
31
27
15
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45398103--45398277
86
2.0
85
84
5
228
32
26
15
26
1.96
45399673--45399824
3
51.3
3
77
12
154
64
1
3
30
1.20
45399652--45399813
30
5.4
29
72
16
75
64
2
5
27
1.29
45399876--45400036
20
8.1
20
67
17
59
57
3
9
30
1.46
45400796--45400828
16
1.9
17
88
11
50
75
3
6
15
1.11
45400967--45401063
49
2.0
49
100
0
194
12
20
19
47
1.81
45401578--45401871
44
6.7
44
74
7
186
28
21
20
28
1.98
45401578--45401742
88
1.9
88
83
0
213
30
21
20
28
1.98
45401966--45402541
44
13.0
44
67
10
249
27
27
17
27
1.98
45401861--45402541
178
3.8
178
88
1
965
27
26
18
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770