Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  54  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15671528--15671585
26
2.3
25
87
3
80
44
13
5
36
1.66
15687227--15687330
3
34.7
3
100
0
208
33
32
0
33
1.58
15689962--15690009
16
3.0
16
87
6
62
50
0
0
50
1.00
15690329--15690373
15
2.9
16
77
9
58
26
13
4
55
1.57
15692455--15692552
49
2.0
49
100
0
196
42
4
12
40
1.61
15698078--15698181
42
2.5
42
91
0
172
30
16
25
27
1.96
15700606--15700636
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
15700603--15700642
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
15700884--15701088
55
3.8
53
79
10
227
22
24
16
35
1.95
15706698--15706854
42
3.7
42
81
3
172
29
15
26
28
1.96
15709466--15709673
40
5.2
39
82
1
200
25
25
21
26
2.00
15709481--15709671
80
2.4
81
84
4
235
24
25
22
27
2.00
15713588--15713716
55
2.4
54
83
5
152
25
27
24
22
2.00
15714472--15714647
44
3.8
46
77
12
162
25
28
20
25
1.99
15714528--15714743
47
4.7
46
74
9
163
24
29
21
25
1.99
15714478--15714795
94
3.4
91
79
6
307
23
29
20
26
1.99
15719081--15719292
47
4.6
46
76
9
173
23
29
21
25
1.99
15719033--15719353
94
3.4
91
80
4
302
22
28
20
27
1.99
15720640--15720678
20
2.0
20
85
10
53
38
12
5
43
1.65
15721376--15721424
23
2.1
23
81
7
55
65
2
26
6
1.27
15726503--15726626
25
5.0
24
77
9
115
33
24
16
25
1.96
15729483--15729515
16
2.0
17
88
5
50
36
6
0
57
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15730273--15730494
40
5.6
40
84
8
292
25
27
22
24
2.00
15730273--15730494
82
2.8
79
87
4
304
25
27
22
24
2.00
15738497--15738719
40
5.6
40
86
7
301
25
26
23
24
2.00
15738497--15738719
83
2.8
80
87
4
308
25
26
23
24
2.00
15740101--15740273
46
3.7
46
79
10
208
21
20
27
29
1.98
15740098--15740268
93
1.8
93
93
0
297
21
21
28
28
1.98
15749359--15749399
20
2.0
20
85
4
55
41
19
21
17
1.90
15751037--15751258
40
5.6
40
82
4
254
23
26
24
26
2.00
15759156--15759415
40
6.6
40
79
6
262
23
26
24
25
2.00
15759156--15759415
79
3.3
80
82
4
276
23
26
24
25
2.00
15761463--15761602
18
7.3
19
76
11
81
39
25
24
10
1.87
15761445--15761545
39
2.6
39
88
0
148
37
25
24
11
1.90
15761524--15761602
18
4.2
18
80
15
88
39
26
24
10
1.87
15761485--15761602
57
2.1
57
95
0
209
39
26
23
10
1.86
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Indices
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Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1
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12
8
41
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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