Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  672  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
211374433--211374562
40
3.2
40
78
6
156
23
23
28
25
1.99
211382257--211382316
26
2.3
26
83
11
70
41
16
1
40
1.58
211383273--211383326
20
2.8
20
75
11
58
57
7
0
35
1.27
211386936--211386982
19
2.6
18
75
18
51
76
2
17
4
1.04
211388140--211388204
29
2.2
29
94
0
112
30
16
27
24
1.97
211395624--211395734
29
3.8
29
85
1
114
30
16
31
21
1.95
211403703--211403813
29
3.8
29
85
1
114
30
16
31
21
1.95
211411728--211411809
28
2.9
28
88
1
110
32
14
29
23
1.94
211419780--211419889
29
3.8
28
83
4
103
30
16
31
21
1.95
211419782--211419861
28
2.8
28
88
1
106
33
15
27
23
1.94
211421908--211421932
13
1.9
13
100
0
50
24
8
0
68
1.16
211427502--211427631
40
3.2
40
84
4
174
23
29
24
22
1.99
211435478--211435607
40
3.2
40
84
4
174
23
29
24
22
1.99
211442515--211443045
47
11.4
47
92
1
863
28
30
8
32
1.87
211442515--211443045
138
3.8
140
94
1
904
28
30
8
32
1.87
211442821--211442896
22
3.3
22
66
16
64
26
30
10
32
1.90
211446981--211447252
40
6.9
40
91
2
433
25
31
22
21
1.98
211446981--211447252
119
2.3
119
90
1
431
25
31
22
21
1.98
211449102--211449624
47
11.4
47
89
4
791
28
30
8
32
1.86
211449102--211449624
93
5.7
94
92
4
818
28
30
8
32
1.86
211449102--211449624
140
3.8
141
90
5
827
28
30
8
32
1.86
211453690--211453876
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
211453713--211453876
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
211453713--211453910
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
211459897--211460121
124
1.8
124
85
1
317
30
11
23
34
1.90
211460116--211460245
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
211460078--211460245
80
2.1
80
81
6
198
25
23
27
23
2.00
211466268--211466416
48
3.2
46
81
5
135
29
24
17
28
1.97
211466294--211466431
48
2.9
48
83
0
177
32
26
16
24
1.96
211475852--211476042
78
2.4
81
81
8
223
24
28
22
24
1.99
211475852--211476042
40
4.8
39
79
8
181
24
28
22
24
1.99
211492594--211492938
164
2.1
164
98
1
665
26
15
15
42
1.86
211506854--211506889
17
2.1
17
100
0
72
27
16
16
38
1.90
211516097--211516160
5
12.2
5
78
21
69
18
3
0
78
0.89
211516099--211516178
6
13.7
6
73
15
69
15
3
1
80
0.92
211516100--211516178
16
4.9
16
78
10
81
15
3
1
79
0.93
211519061--211519096
2
18.5
2
94
5
65
52
0
0
47
1.00
211531952--211531990
19
2.1
19
85
0
51
5
17
28
48
1.68
211534188--211534367
40
4.5
39
77
10
161
27
22
26
23
1.99
211542127--211542175
20
2.3
20
83
13
55
61
0
4
34
1.15
211542127--211542175
23
2.2
22
85
10
64
61
0
4
34
1.15
211543710--211543868
83
1.9
83
90
0
255
30
18
15
35
1.93
211543792--211544226
119
3.7
119
92
0
674
28
20
18
32
1.96
211552770--211552897
37
3.4
37
96
1
229
25
31
17
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
211552937--211553088
48
3.2
48
88
0
241
30
27
6
34
1.82
211553080--211553270
49
3.9
49
97
2
368
30
28
8
32
1.86
211553080--211553270
96
2.0
97
97
2
366
30
28
8
32
1.86
211556242--211556319
40
2.0
40
86
0
111
20
28
24
26
1.99
211557066--211557377
40
7.8
40
97
0
552
26
27
19
25
1.99
211559194--211559323
37
3.5
37
92
2
188
26
30
18
23
1.98
211559363--211559514
48
3.2
48
88
0
241
30
27
6
34
1.82
211559506--211559696
49
3.9
49
97
2
368
30
28
8
32
1.86
211559506--211559696
96
2.0
97
97
2
366
30
28
8
32
1.86
211567016--211567104
35
2.6
34
75
19
89
59
1
4
34
1.25
211567045--211567104
18
3.3
18
75
15
61
61
0
3
35
1.12
211571820--211571926
39
2.7
39
86
2
151
26
20
28
24
1.99
211571826--211571964
40
3.5
40
88
2
183
23
21
30
24
1.99
211571825--211571990
79
2.1
79
80
6
185
24
21
28
25
1.99
211579854--211579991
39
3.5
39
88
3
181
23
21
29
24
1.99
211587892--211588062
39
4.3
40
91
3
233
24
21
29
25
1.99
211590539--211590607
27
2.6
27
95
0
120
28
14
26
30
1.95
211590539--211590619
27
3.0
27
85
7
85
29
16
23
30
1.96
211595690--211595839
47
3.1
47
90
3
255
34
8
29
28
1.86
211595831--211596030
48
4.2
48
94
0
346
32
6
29
32
1.82
211596070--211596158
37
2.4
37
96
1
160
22
17
33
25
1.96
211607743--211607872
40
3.3
39
79
4
136
23
26
24
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
211613222--211613302
36
2.2
36
82
4
92
34
16
13
35
1.88
211613242--211613305
18
3.6
18
83
8
85
32
15
14
37
1.87
211613698--211613734
19
2.0
19
89
5
58
37
10
2
48
1.52
211616122--211616250
50
2.5
51
85
5
163
35
15
21
27
1.94
211616226--211616374
31
4.8
31
93
0
244
26
19
28
26
1.99
211616474--211616604
42
2.9
48
86
9
159
29
15
25
29
1.96
211616534--211616648
42
2.7
43
89
4
171
30
14
26
27
1.95
211617895--211617939
19
2.4
18
86
13
65
0
33
0
66
0.92
211618009--211618035
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
211622709--211622815
26
4.2
26
92
1
180
36
23
7
32
1.83
211630522--211630729
40
5.2
40
84
0
218
25
22
25
25
2.00
211630523--211630729
80
2.6
80
83
4
247
25
22
26
25
2.00
211638667--211638874
40
5.2
40
84
0
218
25
22
25
25
2.00
211638668--211638874
80
2.6
80
83
4
247
25
22
26
25
2.00
211646464--211646653
39
4.9
39
94
1
319
21
31
22
24
1.98
211646464--211646654
77
2.4
78
93
1
330
21
31
22
24
1.98
211648936--211648984
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
211649805--211649971
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
211660192--211660261
35
2.0
35
100
0
140
34
11
22
31
1.90
211662265--211662426
39
4.2
39
89
1
245
23
20
32
24
1.98
211662284--211662462
39
4.6
40
86
0
148
22
21
32
22
1.98
211670970--211671122
39
3.9
39
93
0
261
22
20
32
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
211670971--211671153
39
4.6
39
90
0
258
22
22
31
22
1.98
211670977--211671191
78
2.7
78
85
5
227
23
22
31
22
1.99
211678934--211679096
39
4.2
39
90
0
254
23
20
32
23
1.98
211678934--211679127
39
4.9
39
87
0
244
23
21
31
23
1.98
211681062--211681147
31
2.8
31
87
1
138
23
24
18
33
1.97
211681292--211681374
25
3.4
25
88
5
116
27
22
21
27
1.99
211681422--211681470
11
4.7
11
80
12
59
32
18
12
36
1.88
211683448--211683545
24
4.0
24
93
1
160
35
5
38
20
1.75
211684794--211684846
26
2.0
26
82
7
63
39
22
16
20
1.92
211685157--211685237
33
2.4
34
77
8
94
28
18
23
29
1.98
211685157--211685248
32
2.8
31
72
9
76
26
19
26
28
1.99
211689921--211690131
47
4.5
47
96
0
368
29
12
31
26
1.92
211690251--211690277
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
211692537--211693019
40
12.1
40
96
0
849
26
22
25
25
2.00
211696491--211696706
47
4.6
47
95
0
369
30
12
31
26
1.92
211696680--211696769
46
2.0
46
88
0
135
34
7
30
27
1.85
211699984--211700115
29
4.6
29
82
1
140
25
32
17
25
1.97
211706539--211706670
29
4.6
29
82
1
140
25
32
17
25
1.97
211712808--211712975
40
4.2
40
81
4
178
23
27
23
24
2.00
211717348--211717445
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
211725014--211725111
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
211729501--211729544
2
22.0
2
85
0
61
50
6
0
43
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
211729501--211729544
12
3.5
12
88
11
70
50
6
0
43
1.29
211729501--211729544
14
3.3
14
93
6
74
50
6
0
43
1.29
211731996--211732179
40
4.6
40
82
4
174
28
22
26
23
1.99
211740031--211740131
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
211740031--211740213
40
4.6
40
82
3
181
27
22
26
23
1.99
211743816--211743876
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
211750847--211751056
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
211758911--211758938
14
2.0
14
100
0
56
50
7
0
42
1.30
211759409--211759481
27
2.6
28
95
2
130
28
13
24
32
1.94
211763887--211764057
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770