Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  338  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103443758--103443869
27
4.1
27
87
6
147
37
22
23
16
1.94
103443758--103443869
54
2.1
54
88
3
163
37
22
23
16
1.94
103445564--103445692
46
2.8
46
95
0
222
29
29
21
19
1.98
103445572--103445711
46
3.0
45
88
4
140
28
29
21
20
1.98
103453024--103453195
93
1.8
93
94
0
308
28
27
21
22
1.99
103453017--103453192
46
3.8
46
77
12
198
29
27
21
21
1.98
103454900--103455067
40
4.2
40
80
12
175
23
22
27
26
1.99
103454900--103455067
80
2.1
79
86
4
230
23
22
27
26
1.99
103470685--103470718
17
2.0
17
94
0
59
35
5
26
32
1.81
103473183--103473278
13
7.2
13
72
24
51
22
1
4
71
1.09
103473198--103473240
17
2.6
16
82
17
52
25
0
6
67
1.15
103473183--103473281
16
6.1
16
71
21
73
23
1
4
71
1.09
103473390--103473435
12
3.8
12
82
8
58
19
0
2
78
0.86
103473398--103473440
12
4.0
10
77
16
50
16
0
2
81
0.79
103475061--103475108
24
2.0
24
95
0
87
29
2
27
41
1.67
103479557--103479585
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
103480741--103480797
28
2.0
28
89
0
87
40
15
21
22
1.91
103480884--103480956
38
1.9
38
100
0
146
28
10
9
50
1.69
103481252--103481422
46
3.7
46
72
7
141
30
20
26
22
1.98
103481482--103481654
49
3.6
49
78
5
156
27
19
28
24
1.99
103487185--103487352
40
4.2
39
81
11
162
23
20
27
28
1.99
103487185--103487352
80
2.1
79
83
6
205
23
20
27
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103492022--103492122
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
103492051--103492126
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
103496910--103497058
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
103496951--103497058
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
103513610--103513867
38
6.7
38
85
8
326
24
22
26
26
2.00
103515472--103515510
19
2.1
19
85
0
51
71
7
5
15
1.26
103515974--103516063
28
3.2
26
78
7
81
33
24
22
20
1.97
103516169--103516236
28
2.4
28
92
0
109
30
7
27
33
1.84
103521095--103521138
23
1.9
23
85
0
61
36
6
11
45
1.67
103523462--103523609
48
3.1
48
86
0
206
36
6
25
31
1.82
103531102--103531362
40
6.6
40
82
5
298
24
26
23
25
2.00
103531102--103531362
80
3.3
79
85
3
328
24
26
23
25
2.00
103531102--103531362
120
2.2
121
84
8
340
24
26
23
25
2.00
103537259--103537426
40
4.2
40
82
2
196
25
27
22
25
2.00
103544547--103544771
40
5.6
40
83
2
281
23
28
24
24
2.00
103544511--103544771
80
3.3
80
82
3
294
23
27
23
24
2.00
103553521--103553692
93
1.8
93
94
0
308
27
29
20
21
1.98
103553514--103553689
46
3.8
46
78
12
207
28
29
20
21
1.98
103556094--103556123
14
2.1
14
93
0
51
63
10
6
20
1.47
103563009--103563190
48
3.8
48
90
2
276
25
18
29
26
1.98
103563009--103563236
96
2.4
94
85
4
287
25
17
29
27
1.97
103563009--103563236
48
4.8
48
88
4
255
25
17
29
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103567190--103567416
47
4.7
47
89
4
303
29
31
7
31
1.85
103567190--103567416
96
2.4
96
89
4
336
29
31
7
31
1.85
103569521--103569680
49
3.3
49
94
1
270
30
28
7
33
1.85
103575489--103575718
40
5.8
40
95
1
392
24
27
21
26
1.99
103577838--103578105
47
5.7
47
91
2
389
29
31
7
32
1.85
103577838--103578105
93
2.9
93
89
5
373
29
31
7
32
1.85
103581358--103581408
25
2.1
23
82
7
57
50
3
19
25
1.64
103582477--103582543
28
2.4
28
97
0
125
34
23
26
14
1.94
103584903--103585061
43
3.7
42
75
6
133
27
16
25
30
1.97
103585226--103585262
16
2.2
17
90
4
58
45
5
16
32
1.70
103587688--103587775
27
3.2
26
80
13
90
36
22
22
18
1.95
103587671--103587775
54
1.9
54
83
7
133
37
19
23
20
1.94
103588920--103588953
16
2.1
16
94
0
59
52
8
32
5
1.56
103595555--103595657
27
3.8
27
76
10
102
35
20
23
20
1.96
103599135--103599252
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
103599103--103599266
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
103606691--103606808
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
103606659--103606822
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
103610159--103610418
48
5.5
46
74
11
179
26
19
28
25
1.98
103611594--103611633
21
2.0
21
90
5
64
12
35
30
22
1.91
103617823--103617947
46
2.7
47
83
5
164
26
20
27
25
1.99
103617823--103618085
48
5.6
46
73
12
169
26
19
28
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103617920--103618424
267
1.9
267
89
0
785
27
18
26
27
1.98
103619856--103619894
8
4.9
8
81
12
53
51
23
20
5
1.67
103620109--103620223
29
4.0
28
80
6
115
27
14
28
28
1.95
103625623--103625732
18
5.8
18
73
12
69
35
0
3
60
1.21
103625638--103625700
27
2.3
27
83
8
74
42
1
1
53
1.19
103625669--103625721
20
2.7
20
83
16
67
35
0
3
60
1.15
103627689--103627728
21
1.9
21
85
10
55
30
2
7
60
1.38
103627688--103627735
20
2.3
20
79
10
53
33
2
6
58
1.35
103634186--103634370
40
4.7
40
88
6
252
24
21
27
27
1.99
103634186--103634403
79
2.7
79
85
6
273
25
21
27
26
1.99
103638402--103638473
31
2.3
32
83
7
85
40
0
5
54
1.24
103638747--103638793
2
23.5
2
100
0
94
51
0
0
48
1.00
103648542--103648593
25
2.1
25
96
0
95
53
0
9
36
1.34
103650642--103650751
42
2.6
43
81
4
134
27
20
24
27
1.99
103657949--103658067
42
2.8
42
81
10
134
25
19
24
31
1.98
103662379--103662582
40
5.1
39
83
4
221
27
26
21
24
1.99
103669844--103670087
40
6.1
40
86
2
294
27
26
21
25
1.99
103672608--103672647
17
2.4
17
91
0
62
52
5
12
30
1.60
103678546--103678655
40
2.8
40
82
0
139
23
25
23
27
2.00
103680600--103680783
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
103680640--103680828
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
103688712--103688895
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103688752--103688940
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
103692409--103692540
29
4.6
29
91
0
201
26
15
32
25
1.95
103700463--103700565
29
3.6
29
98
0
197
25
14
32
28
1.95
103700593--103700753
29
5.6
29
93
0
259
26
14
32
26
1.95
103700421--103700695
130
2.1
130
99
0
541
25
14
33
27
1.94
103708077--103708260
29
6.3
29
91
0
269
33
29
13
24
1.93
103716334--103716419
43
2.0
43
84
8
113
26
29
19
24
1.99
103723871--103723963
43
2.2
42
83
7
116
35
25
16
22
1.94
103723885--103723997
43
2.6
43
83
5
131
31
24
15
27
1.96
103724399--103724434
18
1.9
19
88
5
56
63
0
25
11
1.27
103725736--103725867
59
2.3
58
95
1
237
37
13
24
24
1.91
103725706--103725867
88
1.8
89
89
1
254
36
13
24
25
1.92
103725736--103725867
29
4.5
29
95
1
237
37
13
24
24
1.91
103729683--103729797
43
2.7
44
81
8
112
25
17
26
31
1.97
103732383--103732418
18
2.0
18
100
0
72
22
11
11
55
1.66
103736892--103736921
16
1.9
16
93
6
53
40
13
13
33
1.83
103737338--103737467
43
3.0
42
71
5
118
29
15
23
31
1.95
103737710--103737778
34
2.0
34
100
0
138
20
8
17
53
1.69
103740242--103740340
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
103747923--103748021
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
103751821--103751887
20
3.3
20
95
0
125
35
11
19
32
1.88
103751832--103751887
11
5.5
11
75
16
66
35
12
19
32
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103751938--103752019
24
3.4
24
85
9
96
29
21
23
25
1.99
103752229--103752311
38
2.4
34
86
13
109
34
18
24
22
1.96
103754544--103754714
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
103762643--103762813
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
103764576--103764649
37
2.0
37
97
0
139
28
27
6
37
1.82
103766542--103766704
40
4.1
40
82
9
192
24
27
23
24
2.00
103772487--103772649
39
4.2
39
93
0
263
23
20
31
24
1.98
103772487--103772679
39
4.9
39
90
0
251
23
21
31
23
1.98
103782081--103782181
28
3.5
30
79
6
109
30
14
25
28
1.95
103785182--103785250
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770