Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  219  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65424186--65424333
27
5.6
27
75
4
131
31
27
14
27
1.95
65425414--65425438
13
1.9
13
100
0
50
8
8
4
80
1.03
65428812--65429002
40
4.8
39
81
5
161
23
22
28
25
1.99
65428811--65429027
79
2.7
77
78
9
195
23
22
27
26
1.99
65441712--65441864
40
3.9
38
81
6
146
24
22
28
24
1.99
65441673--65441864
79
2.4
81
82
8
225
23
22
28
25
1.99
65441673--65441889
79
2.7
77
79
11
197
23
22
27
26
1.99
65444921--65445021
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
65452877--65452977
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
65458686--65458716
12
2.6
12
100
0
62
32
16
9
41
1.80
65461376--65461408
15
2.1
16
88
5
50
21
18
0
60
1.36
65462873--65462974
19
5.2
21
88
8
85
35
17
9
37
1.83
65462890--65462987
19
5.2
19
91
7
155
35
17
10
36
1.84
65462912--65462968
17
3.5
15
88
11
53
35
15
10
38
1.82
65462890--65462987
36
2.6
37
88
9
144
35
17
10
36
1.84
65463828--65464365
84
6.4
84
89
4
784
25
22
22
29
1.99
65463883--65464024
43
3.3
43
70
15
132
25
21
22
30
1.99
65463832--65464366
250
2.1
250
88
4
808
25
22
22
29
1.99
65464133--65464355
41
5.3
43
64
14
133
27
22
21
28
1.99
65464041--65464323
41
6.9
42
65
18
121
26
23
22
28
1.99
65465317--65465357
6
6.8
6
86
10
50
12
2
0
85
0.70
65465308--65465347
14
2.9
13
89
10
62
12
0
0
87
0.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65465309--65465347
20
2.0
20
100
0
78
12
0
0
87
0.55
65465311--65465367
10
5.9
10
80
15
50
10
5
0
84
0.77
65470496--65470601
26
4.2
26
95
4
198
31
6
26
35
1.82
65470496--65470601
50
2.1
52
96
3
198
31
6
26
35
1.82
65473533--65473605
36
2.0
38
91
5
123
35
15
9
39
1.80
65473533--65473611
19
4.2
19
88
9
117
35
16
8
39
1.80
65474049--65474577
84
6.3
83
85
5
676
24
22
22
30
1.99
65474049--65474577
250
2.1
247
85
5
697
24
22
22
30
1.99
65474137--65474521
41
9.2
41
66
21
167
23
22
23
30
1.99
65475524--65475601
1
78.0
1
74
0
57
1
12
0
85
0.65
65475524--65475601
7
10.7
7
78
16
79
1
12
0
85
0.65
65475524--65475601
22
3.6
21
78
14
86
1
12
0
85
0.65
65475524--65475599
10
7.6
10
78
14
77
1
13
0
85
0.66
65477301--65477467
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
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25
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19
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17
23
1.96
65485301--65485467
40
4.2
40
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25
27
21
25
1.99
65485301--65485467
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
65486292--65486337
17
2.5
19
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22
53
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17
23
1.96
65489280--65489318
19
1.9
20
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65489381--65489539
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5.9
27
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10
200
34
22
24
18
1.96
65489381--65489542
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3.0
54
92
2
256
34
22
24
18
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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19
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1.82
65496946--65497098
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65496946--65497098
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2.2
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44
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28
24
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31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.00
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65534992--65535061
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
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1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65559855--65559930
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2
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34
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31
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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